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Pipig金蟲 (小有名氣)
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[求助]
【TAIL-PCR】對于其測序結(jié)果的分析問題 已有2人參與
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請問有做過TAIL-PCR 的朋友嗎？ 在把擴(kuò)增得到的序列送測序后，改如何分析呢。請說一下詳細(xì)步驟。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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你好，我想問一下你，關(guān)于tail-pcr測序結(jié)果比對的問題，你解決了嗎？因?yàn)槲椰F(xiàn)在遇到了相關(guān)問題，想從你這獲取點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)。希望你能幫我解答一下我的問題  我的問題是 tail-pcr的測序結(jié)果我是用DNAman進(jìn)行比對的，向左側(cè)擴(kuò)增的序列結(jié)果，按理來說應(yīng)該反向互補(bǔ)后進(jìn)行比對，能比對上已知序列5'端的部分序列，對吧？向右擴(kuò)增的序列結(jié)果，直接拿來與已知序列進(jìn)行比對就行，對吧？ 問題是，比對序列時，擴(kuò)增的序列在與已知序列重疊一部分后（約20-70bp），就不會再有重疊序列了，這是正常的嗎？例如，已知序列是1-500bp，左側(cè)擴(kuò)增序列是1-800bp，擴(kuò)增序列的600-630bp能與已知序列的1-30bp重疊，之后的630-800bp就不能喝已知序列30bp以后的序列重疊，這是正常的嗎？ 謝謝你，看能否幫忙解答一下？  |
9樓2016-03-08 11:36:23
kobe199613
木蟲之王 (知名作家)
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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TAIL-PCR（thermal asymmetric interlaced PCR），即交錯式熱不對稱PCR，是一種染色體步移技術(shù)（Genome Walking）。該技術(shù)通過3個嵌套的特異性引物分別和簡并引物組合進(jìn)行連續(xù)的PCR循環(huán)，利用不同的退火溫度選擇性地?cái)U(kuò)增目標(biāo)片段，所獲得的片段可以直接用做探針標(biāo)記和測序模板。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2015-09-17 01:41:47
3樓2015-09-17 12:40:47
Pipig
金蟲 (小有名氣)
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4樓2015-09-20 22:42:12
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