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Pipig金蟲 (小有名氣)
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[求助]
【TAIL-PCR】對于其測序結(jié)果的分析問題 已有2人參與
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請問有做過TAIL-PCR 的朋友嗎? 在把擴(kuò)增得到的序列送測序后,改如何分析呢。請說一下詳細(xì)步驟。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲之王 (知名作家)
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TAIL-PCR(thermal asymmetric interlaced PCR),即交錯式熱不對稱PCR,是一種染色體步移技術(shù)(Genome Walking)。該技術(shù)通過3個嵌套的特異性引物分別和簡并引物組合進(jìn)行連續(xù)的PCR循環(huán),利用不同的退火溫度選擇性地擴(kuò)增目標(biāo)片段,所獲得的片段可以直接用做探針標(biāo)記和測序模板。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

金蟲 (小有名氣)
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是 |
金蟲 (小有名氣)
金蟲 (小有名氣)
你好,我想問一下你,關(guān)于tail-pcr測序結(jié)果比對的問題,你解決了嗎?因為我現(xiàn)在遇到了相關(guān)問題,想從你這獲取點經(jīng)驗。希望你能幫我解答一下我的問題 ![]() 我的問題是 tail-pcr的測序結(jié)果我是用DNAman進(jìn)行比對的,向左側(cè)擴(kuò)增的序列結(jié)果,按理來說應(yīng)該反向互補后進(jìn)行比對,能比對上已知序列5'端的部分序列,對吧?向右擴(kuò)增的序列結(jié)果,直接拿來與已知序列進(jìn)行比對就行,對吧? 問題是,比對序列時,擴(kuò)增的序列在與已知序列重疊一部分后(約20-70bp),就不會再有重疊序列了,這是正常的嗎?例如,已知序列是1-500bp,左側(cè)擴(kuò)增序列是1-800bp,擴(kuò)增序列的600-630bp能與已知序列的1-30bp重疊,之后的630-800bp就不能喝已知序列30bp以后的序列重疊,這是正常的嗎? 謝謝你,看能否幫忙解答一下? |
新蟲 (初入文壇)
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