請問False discovery rate(FDR)是什么意思,生物統(tǒng)計學里怎么用,最好有舉個例子。非常感謝! 返回小木蟲查看更多
https://en.wikipedia.org/wiki/False_discovery_rate
False discovery rate 發(fā)現(xiàn)錯誤率 數據分析中常碰見多重檢驗問題(multiple testing).Benjamini于1995年提出一種方法,通過控制FDR(False Discovery Rate)來決定P值的域值. 假設你挑選了R個差異表達的基因,其中有S個是真正有差異表達的,另外有V個其實是沒有差異表達的,是假陽性的.實踐中希望錯誤比例Q=V/R平均而言不能超過某個預先設定的值(比如0.05),在統(tǒng)計學上,這也就等價于控制FDR不能超過5%.
這是一種統(tǒng)計的方法,是統(tǒng)計學上的一種函數,是多重檢驗中的FDR錯誤控制方法。一般的步驟可以為: 根據Benjamini在他的文章中所證明的定理,控制fdr的步驟實際上非常簡單。 設總共有m個候選基因,每個基因對應的p值從小到大排列分別是p(1),p(2),...,p(m),則若想控制fdr不能超過q,則只需找到最大的正整數i,使得 p(i)<= (i*q)/m.然后,挑選對應p(1),p(2),...,p(i)的基因做為差異表達基因,這樣就能從統(tǒng)計學上保證fdr不超過q,
誤現(xiàn)率??
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https://en.wikipedia.org/wiki/False_discovery_rate
False discovery rate
發(fā)現(xiàn)錯誤率
數據分析中常碰見多重檢驗問題(multiple testing).Benjamini于1995年提出一種方法,通過控制FDR(False Discovery Rate)來決定P值的域值. 假設你挑選了R個差異表達的基因,其中有S個是真正有差異表達的,另外有V個其實是沒有差異表達的,是假陽性的.實踐中希望錯誤比例Q=V/R平均而言不能超過某個預先設定的值(比如0.05),在統(tǒng)計學上,這也就等價于控制FDR不能超過5%.
這是一種統(tǒng)計的方法,是統(tǒng)計學上的一種函數,是多重檢驗中的FDR錯誤控制方法。一般的步驟可以為:
根據Benjamini在他的文章中所證明的定理,控制fdr的步驟實際上非常簡單。
設總共有m個候選基因,每個基因對應的p值從小到大排列分別是p(1),p(2),...,p(m),則若想控制fdr不能超過q,則只需找到最大的正整數i,使得 p(i)<= (i*q)/m.然后,挑選對應p(1),p(2),...,p(i)的基因做為差異表達基因,這樣就能從統(tǒng)計學上保證fdr不超過q,
誤現(xiàn)率??