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發(fā)金幣求False discovery rate（FDR）是什么意思
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| 請(qǐng)問False discovery rate（FDR）是什么意思，生物統(tǒng)計(jì)學(xué)里怎么用，最好有舉個(gè)例子。非常感謝！ |
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boouy
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2樓2010-08-15 09:17:56
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園藝(金幣+1):非常感謝 2010-08-18 08:20:36
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False discovery rate 發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤率 數(shù)據(jù)分析中常碰見多重檢驗(yàn)問題(multiple testing).Benjamini于1995年提出一種方法,通過控制FDR(False Discovery Rate)來決定P值的域值. 假設(shè)你挑選了R個(gè)差異表達(dá)的基因，其中有S個(gè)是真正有差異表達(dá)的，另外有V個(gè)其實(shí)是沒有差異表達(dá)的，是假陽性的.實(shí)踐中希望錯(cuò)誤比例Q＝V/R平均而言不能超過某個(gè)預(yù)先設(shè)定的值（比如0.05），在統(tǒng)計(jì)學(xué)上，這也就等價(jià)于控制FDR不能超過5％. |
3樓2010-08-15 09:19:57
zhaohaixing
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園藝(金幣+2, 博學(xué)EPI+1):非常感謝 2010-08-18 08:20:20
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這是一種統(tǒng)計(jì)的方法，是統(tǒng)計(jì)學(xué)上的一種函數(shù)，是多重檢驗(yàn)中的FDR錯(cuò)誤控制方法。一般的步驟可以為： 根據(jù)Benjamini在他的文章中所證明的定理，控制fdr的步驟實(shí)際上非常簡(jiǎn)單。 設(shè)總共有m個(gè)候選基因，每個(gè)基因?qū)?yīng)的p值從小到大排列分別是p(1),p(2),...,p(m),則若想控制fdr不能超過q，則只需找到最大的正整數(shù)i，使得 p(i)<= (i*q)/m.然后，挑選對(duì)應(yīng)p(1),p(2),...,p(i)的基因做為差異表達(dá)基因，這樣就能從統(tǒng)計(jì)學(xué)上保證fdr不超過q。 |
4樓2010-08-15 09:53:07
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5樓2010-08-15 11:03:47
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