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[交流]
發(fā)金幣求False discovery rate(FDR)是什么意思
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| 請問False discovery rate(FDR)是什么意思,生物統(tǒng)計學(xué)里怎么用,最好有舉個例子。非常感謝! |
銀蟲 (正式寫手)
至尊木蟲 (著名寫手)
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False discovery rate 發(fā)現(xiàn)錯誤率 數(shù)據(jù)分析中常碰見多重檢驗問題(multiple testing).Benjamini于1995年提出一種方法,通過控制FDR(False Discovery Rate)來決定P值的域值. 假設(shè)你挑選了R個差異表達的基因,其中有S個是真正有差異表達的,另外有V個其實是沒有差異表達的,是假陽性的.實踐中希望錯誤比例Q=V/R平均而言不能超過某個預(yù)先設(shè)定的值(比如0.05),在統(tǒng)計學(xué)上,這也就等價于控制FDR不能超過5%. |

榮譽版主 (著名寫手)
心靜、靜心
![]() |
專家經(jīng)驗: +6 |
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這是一種統(tǒng)計的方法,是統(tǒng)計學(xué)上的一種函數(shù),是多重檢驗中的FDR錯誤控制方法。一般的步驟可以為: 根據(jù)Benjamini在他的文章中所證明的定理,控制fdr的步驟實際上非常簡單。 設(shè)總共有m個候選基因,每個基因?qū)?yīng)的p值從小到大排列分別是p(1),p(2),...,p(m),則若想控制fdr不能超過q,則只需找到最大的正整數(shù)i,使得 p(i)<= (i*q)/m.然后,挑選對應(yīng)p(1),p(2),...,p(i)的基因做為差異表達基因,這樣就能從統(tǒng)計學(xué)上保證fdr不超過q。 |

木蟲 (小有名氣)
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