【求助】晶體中手性的問題?高人請(qǐng)進(jìn),金幣不是問題。!
自己合成出一個(gè)新的有機(jī)化合物,含有一個(gè)手性中心,未經(jīng)拆分即為
消旋體(R和S的混合物),將這個(gè)消旋體進(jìn)行單晶培養(yǎng),并進(jìn)行了測量。
疑問1:這個(gè)單晶是單純的R體?單純的S體?還是消旋體(R和S的混合物)?
該怎么鑒別呢?
2: 我個(gè)人懷疑我的這個(gè)單晶為消旋體(R和S的混合物),我還想拿其發(fā)文章,JMS期刊的(拿混旋體發(fā)文章可以嗎?),但很害怕審稿人問手性的問題,到時(shí)候確實(shí)不知道怎么回答才好。
高手幫幫我吧,很是擔(dān)心,怎么解決?怎么回答好呢?
以前為過類似問題,可始終沒有準(zhǔn)確答案。
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
這個(gè)沒關(guān)系嗎,不嫌麻煩就測一下旋光,各向異性等性質(zhì)。嫌麻煩就看看你的單晶數(shù)據(jù)就行了,手性晶體解出來是手性空間群嗎,看看不就成了。是手性就看看FLACK參數(shù),不是就直接正常處理了。
我做個(gè)兩個(gè)單晶,數(shù)據(jù)如下:這兩個(gè)都是手性空間群嗎?是手性分子嗎?分別看了cif何LST,為找到Flank參數(shù)啊,新手請(qǐng)多多指教。
(我是拿兩個(gè)消旋體培養(yǎng)的單晶并進(jìn)行了測量,不知測得的單晶是R ,S 還是R和S混合體)
1
_symmetry_cell_setting Monoclinic
_symmetry_space_group_name_H-M 'C 2/c'
_symmetry_space_group_name_Hall '-C 2yc'
2
_symmetry_cell_setting Trigonal
_symmetry_space_group_name_H-M R-3
_symmetry_space_group_name_Hall '-R 3'
,
我記得 C2/c 和 R-3 都不是手性群。
那您的意思就是這兩個(gè)單晶數(shù)據(jù)都沒有Flanck參數(shù)了?
不過我有一點(diǎn)不是太明白:我培養(yǎng)時(shí)確實(shí)是拿混旋體培養(yǎng)的單晶,那么培養(yǎng)出來的單晶肯定是單純的R體或單純的S體或R和S的混合體這三種情況中的一種吧?
我的這兩個(gè)單晶到底時(shí)那種呢?我該如何去看呢?
這兩個(gè)單晶的cif在Check網(wǎng)站核查時(shí),均提示我均是R體。對(duì)嗎?我不因該相信吧?可我有不知如何去看屬于三種情況中的那種。
望高手幫幫我。
這個(gè)空間群具有手性,不一定該晶體具有手性
就空間群來說,你的晶體應(yīng)該不是手性化合物,所以找不到Flack參數(shù)也就很正常了。
在cif文件中是這兩行:
'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881'
_refine_ls_abs_structure_Flack -0.06(8)
Flack 因子接近0,絕對(duì)構(gòu)型正確;接近1絕對(duì)構(gòu)型定反需要翻轉(zhuǎn);在0.5左右可能是倒反孿晶。
根據(jù)我的經(jīng)驗(yàn)?zāi)愕膯栴}不是絕對(duì)構(gòu)型是否定對(duì),而是是否存在共結(jié)晶的問題。
如果投文章時(shí),審稿人問到我的晶體究竟是R,S還是R和S的混合體?我該如何回答呢?