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[交流]
【求助】晶體中手性的問題?高人請進,金幣不是問題。!
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自己合成出一個新的有機化合物,含有一個手性中心,未經拆分即為 消旋體(R和S的混合物),將這個消旋體進行單晶培養(yǎng),并進行了測量。 疑問1:這個單晶是單純的R體?單純的S體?還是消旋體(R和S的混合物)? 該怎么鑒別呢? 2: 我個人懷疑我的這個單晶為消旋體(R和S的混合物),我還想拿其發(fā)文章,JMS期刊的(拿混旋體發(fā)文章可以嗎?),但很害怕審稿人問手性的問題,到時候確實不知道怎么回答才好。 高手幫幫我吧,很是擔心,怎么解決?怎么回答好呢? 以前為過類似問題,可始終沒有準確答案。 |
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我做個兩個單晶,數據如下:這兩個都是手性空間群嗎?是手性分子嗎?分別看了cif何LST,為找到Flank參數啊,新手請多多指教。 (我是拿兩個消旋體培養(yǎng)的單晶并進行了測量,不知測得的單晶是R ,S 還是R和S混合體) 1 _symmetry_cell_setting Monoclinic _symmetry_space_group_name_H-M 'C 2/c' _symmetry_space_group_name_Hall '-C 2yc' 2 _symmetry_cell_setting Trigonal _symmetry_space_group_name_H-M R-3 _symmetry_space_group_name_Hall '-R 3' |
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對空間群這個東西我也不懂,不過我記得C2是手性空間群,但是:晶體結構是手性的,則空間群必定是手性的?臻g群是手性的,其中的晶體未必是手性的! 舉個例子講,你測出來的空間群(假設用PLATON檢測空間群沒有問題)是手性空間群,則你的測試的單晶很可能是手性晶體,如果用鉬靶至少要有P(?)原子或更重的原子存在,反常散射才會明顯,如果是銅靶至少要有O(?)或更重的原子存在,這樣才能看FLACK常數是否接近0(誤差也要在合理范圍內如 0.02(80)這個顯然不對了)來確定絕對結構。如果FLACK在合理范圍內,你測試的哪個單晶很可能是手性,再看看結構,有時候不是因為手性分子的原因導致你的空間群是手性空間群,比如本來是一種化合物但是由于無序導致有些基團取向發(fā)生了變化,解出來會看到兩個分子有不同的伸展方向。 如果你用的鉬靶又沒有重原子,反常散射不明顯,就不能通過晶體結構鑒定絕對構型了,可以用其他辦法,如核磁(二維?)或手性柱或CD。 我是自學的,又不是做單晶這行的,所以只能如此謬解。希望能夠幫到樓主。 手頭上一下子又沒書籍,只能這么回答了。 https://www.crystalstar.org/cstarbbsxp/ShowPost.htm?id=1342 [ Last edited by vink on 2011-3-11 at 19:08 ] |
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