測序樣品處理的問題
有沒有大蝦做過果實類感抗病（真菌）基因的？有兩個方面需要求助：
1、接種上病原菌后采樣點的設(shè)定原則？
2、果實送樣部位（是果實發(fā)病嚴重的部位或交接處還是無病征的部位）
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
尋找抗病基因，應(yīng)該是感染后選擇抗病強的長勢好的植株或果實來采樣吧。如果是采集受感染嚴重的植株，一般樣品中會混有真菌，如果真菌量很大，你后續(xù)測序得到的大部分都是真菌的數(shù)據(jù)，如果較少如果你的真菌基因信息是已知的可以剔除真菌數(shù)據(jù)，但是如果真菌基因信息數(shù)據(jù)未知那就無法區(qū)分了。
個人的理解：應(yīng)該是設(shè)置一組易感病植株但是不做感染處理當做對照，一組是抗病植株（這要基于前期的實驗篩選得到的植株）。采集兩組植株同一部位進行比較尋找抗病基因，