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wangyx2002木蟲 (正式寫手)
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[求助]
測序樣品處理的問題
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有沒有大蝦做過果實類感抗病（真菌）基因的？有兩個方面需要求助： 1、接種上病原菌后采樣點的設(shè)定原則？ 2、果實送樣部位（是果實發(fā)病嚴(yán)重的部位或交接處還是無病征的部位） |
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yingyangyang 
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wangyx2002: 金幣+15, 博學(xué)EPI+1, ★有幫助, 謝謝。 2015-09-01 10:26:54
wangyx2002: 金幣+15, 博學(xué)EPI+1, ★有幫助, 謝謝。 2015-09-01 10:26:54
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尋找抗病基因，應(yīng)該是感染后選擇抗病強(qiáng)的長勢好的植株或果實來采樣吧。如果是采集受感染嚴(yán)重的植株，一般樣品中會混有真菌，如果真菌量很大，你后續(xù)測序得到的大部分都是真菌的數(shù)據(jù)，如果較少如果你的真菌基因信息是已知的可以剔除真菌數(shù)據(jù)，但是如果真菌基因信息數(shù)據(jù)未知那就無法區(qū)分了。 個人的理解：應(yīng)該是設(shè)置一組易感病植株但是不做感染處理當(dāng)做對照，一組是抗病植株（這要基于前期的實驗篩選得到的植株）。采集兩組植株同一部位進(jìn)行比較尋找抗病基因。 |
2樓2015-08-18 15:34:29
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