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wangyx2002木蟲 (正式寫手)
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[求助]
測序樣品處理的問題
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有沒有大蝦做過果實類感抗。ㄕ婢┗虻?有兩個方面需要求助: 1、接種上病原菌后采樣點的設定原則? 2、果實送樣部位(是果實發(fā)病嚴重的部位或交接處還是無病征的部位) |
木蟲 (正式寫手)
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尋找抗病基因,應該是感染后選擇抗病強的長勢好的植株或果實來采樣吧。如果是采集受感染嚴重的植株,一般樣品中會混有真菌,如果真菌量很大,你后續(xù)測序得到的大部分都是真菌的數(shù)據(jù),如果較少如果你的真菌基因信息是已知的可以剔除真菌數(shù)據(jù),但是如果真菌基因信息數(shù)據(jù)未知那就無法區(qū)分了。 個人的理解:應該是設置一組易感病植株但是不做感染處理當做對照,一組是抗病植株(這要基于前期的實驗篩選得到的植株)。采集兩組植株同一部位進行比較尋找抗病基因。 |
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