如何進(jìn)行基因組序列比對(duì)(在PUBMED中),求相關(guān)的資料,謝謝,感激不盡 返回小木蟲查看更多
有很多生物信息學(xué)軟件可以做,比如lastz,mauve, mumer等等。。都是在linux下命令行進(jìn)行操作的。如果是細(xì)菌基因組的話,也有一些在線比對(duì)的網(wǎng)站可以用。
比較兩個(gè)物種基因組序列的話,最好還是用NCBI這種在線的服務(wù)器,本地PC估計(jì)吃不消,內(nèi)容太大。打開(kāi)https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome,勾選“Align two or more sequence”,在兩個(gè)輸入框輸入兩個(gè)基因組的ID就可以了
請(qǐng)問(wèn)我只測(cè)出單向序列,因?yàn)闀r(shí)間問(wèn)題沒(méi)有再測(cè)互補(bǔ)序列,我需要去比對(duì),但是為什么在Blast里面比對(duì)顯示沒(méi)有結(jié)果呢?是因?yàn)椴皇侨蛄袉幔?br />
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這個(gè)說(shuō)的太簡(jiǎn)單了,我也知道,有沒(méi)有具體一點(diǎn)的步驟
有很多生物信息學(xué)軟件可以做,比如lastz,mauve, mumer等等。。都是在linux下命令行進(jìn)行操作的。如果是細(xì)菌基因組的話,也有一些在線比對(duì)的網(wǎng)站可以用。
比較兩個(gè)物種基因組序列的話,最好還是用NCBI這種在線的服務(wù)器,本地PC估計(jì)吃不消,內(nèi)容太大。打開(kāi)https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome,勾選“Align two or more sequence”,在兩個(gè)輸入框輸入兩個(gè)基因組的ID就可以了
請(qǐng)問(wèn)我只測(cè)出單向序列,因?yàn)闀r(shí)間問(wèn)題沒(méi)有再測(cè)互補(bǔ)序列,我需要去比對(duì),但是為什么在Blast里面比對(duì)顯示沒(méi)有結(jié)果呢?是因?yàn)椴皇侨蛄袉幔?br />
您好,細(xì)菌基因組在線比對(duì)的網(wǎng)站有哪些呀
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