金納米棒修飾DNA
大家好,我最近嘗試往金納米棒上修飾巰基化DNA,利用的是低pH高鹽法修飾,從紫外上能看到260有明顯的DNA吸收峰,合成之后的產(chǎn)物也非常穩(wěn)定,多次離心都能很好地收集到產(chǎn)物(應該不存在DNA脫落等因素);
但是在嘗試結(jié)合互補鏈DNA的時候卻一直都不能夠成功(驗證方式:1. 紫外看產(chǎn)物260吸收峰無明顯變化;2.投入與修飾探針等量的互補鏈DNA,在結(jié)合后未發(fā)現(xiàn)上清中DNA含量變少),想請教下大家這是哪方面出問題了?
嘗試過的影響因素:1、DNA在金納米棒上的修飾比例;2、反應的溫度、pH等
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
存在位阻,DNA不容易互補配對
你可以嘗試先讓DNA互補配對,再把雙鏈DNA連接到金表面
好
我
謝謝建議,你的這種方法我也嘗試過,但似乎DNA雙鏈在低pH高鹽環(huán)境下容易解鏈,沒能成功把互補鏈留。晃液罄m(xù)再嘗試下直接修飾吧,就是時間相對長一點。
另外,想和你探討一下關(guān)于這個DNA鏈的空間位阻影響,這種位阻是不是主要是DNA鏈離金表面太近,如果我把spacer序列長度加大一點,是不是會一定程度消除這種影響?其實我原來已經(jīng)加了5個A了,我現(xiàn)在計劃再加一點,因為我的實驗這個互補鏈上還需要繼續(xù)加互補鏈,做雜交鏈反應形成個長鏈聚合物,所以還是優(yōu)先想考慮解決這個位阻問題
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位阻主要是靜電排斥和空間位阻,如果你后期還要加互補鏈,我覺得還是先雜交再偶聯(lián)好些,只要設(shè)計的互補堿基超過10個,我感覺雜交后的雙鏈沒有那么容易解鏈。關(guān)于加spacer,已經(jīng)加了spacer了,再加spacer感覺影響應該不是很大。
好的,謝謝
可以留個聯(lián)系方式嗎 我最近也遇到了這樣的問題