轉(zhuǎn)錄因子和蛋白互作到底做酵母雙雜和酵母單雜
如題,發(fā)現(xiàn)一個轉(zhuǎn)錄因子,想釣一下下游互作的蛋白,但是看文章有的轉(zhuǎn)錄因子做雙雜有的做單雜,所以請教一下各位大佬,到底做哪一種么呢
(這個轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控BTB蛋白,與細(xì)胞分裂有關(guān),但不知道與下游什么蛋白互作)
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如題,發(fā)現(xiàn)一個轉(zhuǎn)錄因子,想釣一下下游互作的蛋白,但是看文章有的轉(zhuǎn)錄因子做雙雜有的做單雜,所以請教一下各位大佬,到底做哪一種么呢
(這個轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控BTB蛋白,與細(xì)胞分裂有關(guān),但不知道與下游什么蛋白互作)
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
單雜
我覺得可以去送公司建庫,回來做雙雜篩選
雙雜是蛋白-蛋白互作;單雜是DNA-蛋白互作。
單雜是蛋白與DNA互作,如果你是想知道你的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控哪個基因的表達(dá),那么做單雜可以找出下游和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的啟動子序列,再到基因組里面local blast一下,就能知道下游調(diào)控的蛋白是什么了。
雙雜是蛋白與蛋白互作,如果你想知道你的轉(zhuǎn)錄因子是不是會和什么別的蛋白相互結(jié)合,起什么別的作用,那么你就需要做雙雜找到這個直接和你的轉(zhuǎn)錄因子互作的蛋白。
我最近也在篩庫,不對之處還請各位大佬批評指正,
雙雜。