同源重組連載體,長得菌搖不起來,大神們知道怎么回事么?
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本人最近在做同源重組連接,將2-3個片段連接到載體上。
連接酶用的是擎科sosoo同源重組連接酶;載體用的是pBI121載體,長度14758bp。
插入的片段大小1100bp左右;酶切位點用的BamH I單酶切,同源臂是擎科的技術(shù)給我設(shè)計的應(yīng)該沒問題。
載體用TAKARA的快切酶,確認(rèn)酶切開。
連接時摩爾比按兩種形式進(jìn)行計算。1載體:片段=1:10;2載體:總片段=1:10(即插入兩個片段時摩爾比為1:5:5;插入三個片段時摩爾比為1:3:3:3)。
熱激法轉(zhuǎn)入感受態(tài),涂板過夜培養(yǎng)12-16h。第二天版上有長菌,但是挑出來的菌都搖不起來,不知是什么原因。
做過pBI121空載的對照,證明感受態(tài),平板以及含抗生素的LB液體都沒問題。也排除噬菌體干擾。
有懷疑過是不是因為載體太長的緣故,但還是不太明白明明版上的菌長得很好,為什么搖不起來。按理說同源重組應(yīng)該長出來的都是陽性菌株,跪求大神解惑。
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同學(xué)之前也遇到過,重新轉(zhuǎn)化之后好了~
把lb重新配一個吧,我記得當(dāng)時,我?guī)屯瑢W(xué)先挑了一批,很小很小的時候挑的,搖菌長起來了,后來長大一點后,再挑的,就都沒長起來,具體是因為什么就不太清楚了
平板上長出來的菌落有沒有試著做菌落PCR,驗證片段是否連接成功?
從頭驗證下引物,模板,酶切位點等是不是有問題吧,建議重新連接
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