多條基因序列方向判斷
請(qǐng)教一個(gè)小白問題。
我從NCBI上下載了一批基因序列,請(qǐng)問有什么方法可以迅速判斷這些序列的方向性嗎?以至于后面做OTU分析時(shí),不會(huì)因?yàn)樾蛄蟹较蛳喾炊霈F(xiàn)錯(cuò)誤的OTU分組結(jié)果。
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請(qǐng)教一個(gè)小白問題。
我從NCBI上下載了一批基因序列,請(qǐng)問有什么方法可以迅速判斷這些序列的方向性嗎?以至于后面做OTU分析時(shí),不會(huì)因?yàn)樾蛄蟹较蛳喾炊霈F(xiàn)錯(cuò)誤的OTU分組結(jié)果。
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
序列有點(diǎn)長(zhǎng),這是MEGA比對(duì)結(jié)果的部分位置截圖。第一條是Ref序列。
比對(duì)結(jié)果部分截圖.jpg
可以用blast比對(duì)
哦~~~知道了。多條序列一起B(yǎng)LAST,根據(jù)這個(gè)plus/plus來判斷正負(fù)鏈?zhǔn)欠褚恢率前桑?br /> get了。多謝多謝呀!
NCBI比對(duì).jpg
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對(duì)滴