三代基因組測(cè)序疑問(wèn)
1. 三代基因組測(cè)序,PacBio平臺(tái)的數(shù)據(jù),讀長(zhǎng)reads長(zhǎng)度是多少?插入片段長(zhǎng)度是多少?
2. 三代和二代,也有雙端測(cè)序嗎?也是輸出1.fq,2.fq嗎?還是就輸出一個(gè)fq文件?
3. 背景是我要模擬一個(gè)三代測(cè)序數(shù)據(jù),比較幾個(gè)比對(duì),組裝軟件的差異
謝謝大家
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
pacbio插入片段20-30kb左右,三代測(cè)序沒(méi)有雙端測(cè)序的說(shuō)法,輸出的是bam文件
"PaSS: a sequencing simulator for PacBio sequencing",https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31226925/,