這種帶箭頭的基因圖怎么做的?
請教,這種帶箭頭的基因圖是如何畫出來的?用PPT?還是有專門的軟件一鍵出圖?上面的箭頭長短我知道應該是基因片段的長度,但是方向如何確定?有的向左有的向右,整個序列其實是一條基因,上面有很多別的基因片段,就是不知道這個方向是如何確定的,希望能遇見大神指點迷津。感謝

1.png@wizardfan@biostar2009
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請教,這種帶箭頭的基因圖是如何畫出來的?用PPT?還是有專門的軟件一鍵出圖?上面的箭頭長短我知道應該是基因片段的長度,但是方向如何確定?有的向左有的向右,整個序列其實是一條基因,上面有很多別的基因片段,就是不知道這個方向是如何確定的,希望能遇見大神指點迷津。感謝

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京公網安備 11010802022153號
序列軟件 DNAstar 、 SnapGene 了解一下; 一個箭頭表示一個ORF,箭頭向左向右表示轉錄方向(同一基因簇中的不同ORF的轉錄是單獨完成的,有的上鏈是正義鏈,有的下鏈是正義鏈)。
感謝,我現在是只有一竄測序后的基因序列,很長,如何知道這條鏈中不同的ORF的轉錄方向?
這個要自己來確定吧,有部分軟件可以識別出一些常用的序列。未知序列得要自己來確認,然后在軟件上進行標注。
非常感謝,那想知道未知序列的轉錄方向可以通過NCBI查看?還是....,現在有特定的方便查閱序列轉錄方向的網站或者軟件嗎?這些太深的東西我實在是剛接觸,問的有點多
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如果已經有類似的序列的話可以做tblastn之類的進行比對,根據匹配情況就可以判斷是正鏈還是復鏈,不然就只能靠一些軟件做預測了
感謝回復,你是說拿現有的序列進行tblastn?,這樣可以看出正反鏈是嗎?