鏈內(nèi)和鏈間結(jié)合能篩選結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的人源化抗體
通過(guò)理論計(jì)算的方法輔助非人源抗體的人源化設(shè)計(jì),可以減少實(shí)驗(yàn)工作量,節(jié)約成本和時(shí)間,加速抗體藥物研發(fā)[鐘強(qiáng) 2017]。而且,通過(guò)建模得到了人源
化抗體的三維結(jié)構(gòu),可以為后期的抗體設(shè)計(jì)和改造提供理論依據(jù)。因此,開發(fā)抗體人源化的計(jì)算方法受到了研究人員的重視[Tsuchiya and Mizuguchi, 2016;
Nowak et al., 2016; Nguyen et al., 2017; Regep et al., 2017; Kuroda et al., 2020; Sawant et al., 2020]。利用理論計(jì)算方法輔助非人源抗體的人源 化相繼開發(fā)出了多個(gè)人源化抗體[Fransson et al., 2010; Apgar et al., 2016; Margreitter et al., 2016]。以抗體結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),通過(guò)計(jì)算方法可以進(jìn)一步提高抗體藥物的穩(wěn)定性和親和力[Payandeh et al., 2018; Warszawski et al.,2019; Cannon et al., 2019]。利用 CDR 移植和同源建模的方法對(duì)非人源抗體進(jìn)行人源化設(shè)計(jì)已經(jīng)成為重要的手段[Haidar et al., 2012; Hanf et al., 2014;Choi et al., 2016; Kurella et al., 2018; Chowdhury et al., 2018; Zhang et al., 2020]。本研究利用非人源抗體的序列搜索抗體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建 CDR移植抗體結(jié)構(gòu),計(jì)算人源化抗體的鏈內(nèi)和鏈間結(jié)合能,可以篩選出結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的人源化抗體序列,提高人源化實(shí)驗(yàn)的成功率。
鏈接:https://pan.baidu.com/s/1mP1SqxzlKjSb-auXy_GprA
提取碼:3n16
返回小木蟲查看更多
京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)