請教:qRT-PCR驗證RNA-seq的結(jié)果
在很多文獻(xiàn)中,用qRT-PCR驗證RNA-seq的結(jié)果中,往往是qRT-PCR有誤差線(error bar)而RNA-seq沒有,這不是個例,很多文獻(xiàn)的圖就是這樣的。我貼了幾個文獻(xiàn)的截圖,但是這些文獻(xiàn)表明進(jìn)行測序都是至少三次生物學(xué)重復(fù)的,所以沒有誤差線肯定不是因為沒有做生物學(xué)重復(fù)。但是為什么RNA-seq沒有誤差線呢?想請教一下專業(yè)的回答。謝謝各位賜教

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京公網(wǎng)安備 11010802022153號
你這個問題問得非常好
我的理解是,RNA-Seq的基因表達(dá)變化可信度主要是看P值的,這通常是基于樣品整體基因檢測情況并且基于連續(xù)性矯正的,還跟個體基因表達(dá)豐度相關(guān),因此看重復(fù)間誤差意義不大。但qRT-PCR主要是單個基因表達(dá)的獨立檢測,就只能看誤差線了。
感謝您的回答
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