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好孩子壞孩子金蟲 (著名寫手)
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[交流]
Autodock對(duì)接能量小于多少認(rèn)為對(duì)接成功 已有4人參與
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利用Autodock做分子對(duì)接是，對(duì)接能量小于多少認(rèn)為對(duì)接成功呢？ [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
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5樓2016-03-03 09:29:58
張德濤
木蟲 (小有名氣)
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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感覺沒有一個(gè)確定的數(shù)，不是有設(shè)置對(duì)接構(gòu)像的個(gè)數(shù)么？我都是選擇對(duì)接構(gòu)象中能量低的那一個(gè) 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2016-02-29 00:00:54
阿貍1205
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3樓2016-02-29 09:34:11
flyingcity
新蟲 (初入文壇)
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| 要先用晶體結(jié)構(gòu)中的配體進(jìn)行對(duì)接（redock），直到獲得跟晶體結(jié)構(gòu)中很相似的構(gòu)象，以這個(gè)為標(biāo)準(zhǔn)來衡量你新設(shè)計(jì)的化合物的結(jié)合能，對(duì)接結(jié)合能是相對(duì)值，不是絕對(duì)值，所以要先建立參照系。在進(jìn)行redock的時(shí)候，盡量多用幾個(gè)帶配體的晶體結(jié)構(gòu)，看哪個(gè)的配體和你的配體結(jié)構(gòu)類似，就選哪個(gè)。 |
4樓2016-02-29 10:53:19
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