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flyer0505銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
有沒有人做過聚合物和蛋白質(zhì)的分子對接 已有5人參與
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 我現(xiàn)在正在做聚合物與受體蛋白的相互作用研究。真是一個(gè)負(fù)復(fù)雜的過程，聚合物太大整體是不能進(jìn)入結(jié)合位點(diǎn)的，只能考慮聚合物的某個(gè)片段結(jié)合到蛋白的活性位點(diǎn)部位，這是我研究的思路:因?yàn)榫酆衔镦溙L,考慮到蛋白質(zhì)活性位點(diǎn)的空間幾何結(jié)構(gòu)，本人將聚合物切斷為幾個(gè)不同的片段（每個(gè)片段是不同的小分子），分別將它們對接到受體蛋白的結(jié)合位點(diǎn)，然后比較每個(gè)片段的得分（親和力大小），得分大的則認(rèn)為這個(gè)片段會優(yōu)先結(jié)合到受體蛋白的口袋里面，聚合物的其他片段則沒有進(jìn)入到口袋里面。不知道這樣設(shè)計(jì)可不可行，請大家?guī)蛶兔Α?br /> 另外，是否有研究聚合物與受體蛋白相互作用的對接軟件？ |
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