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請求配體受體復合物藥效團誘騙集驗證ROC曲線值的問題?
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我構建完藥效團(Receptor-Ligand pharmacophore)后,選取活性集和非活性集(誘騙集)進行驗證,然后ROC曲線結果最高只有0.6,如何能達到0.7?(我用的軟件是DS3.0)。 我做的此類抑制劑復合物現(xiàn)有解析出并帶有抑制劑的晶體很少,做出的結果是 9 features match the receptor-ligand interactions: AADHHHHPR;钚约x擇的是IC50小于10000nM,根據(jù)結構多樣性挑選50個。非活性集選了其他不同的三種抑制劑,選了1000個,但IC50值沒有要求。 現(xiàn)在我應該進行藥效團修飾(具體怎么做?)還是重新選擇誘騙集(應該依照什么選?),根據(jù)我們實驗室現(xiàn)有的條件,沒有辦法更換其他類復合物,我很苦惱,希望得到有效的解答!謝謝! |

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