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adzhua新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
PSIBLAST生成 PSSM時(shí)間很長(zhǎng)
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萬(wàn)能的蟲(chóng)友我用如下命令： psiblast -db nr -query 2PG3_A.fasta.txt -num_iterations 3 -evalue 0.001 -out_ascii_pssm 2PG3_A 獲取pssm，可是至少需要20分鐘才能得到結(jié)果。是我的命令錯(cuò)了還是nr數(shù)據(jù)太大造成的？（我用psiblast -in_msa 2PG3_A.fasta.txt -out_ascii_pssm pssm1.txt -subject 2PG3_A.fasta.txt很快就得到了結(jié)果。沒(méi)有金幣了  ）。 |
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