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sin81

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[求助] vasp 并行安裝時(shí)openmpi出現(xiàn)錯(cuò)誤已有4人參與

安裝openmpi時(shí)候，用：./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort
make， make install后，能正常結(jié)束，但到example里make時(shí)候，就出現(xiàn)下面錯(cuò)誤：

mpicc -g hello_c.c -o hello_c
--------------------------------------------------------------------------
The Open MPI wrapper compiler was unable to find the specified compiler
pgcc in your PATH.

Note that this compiler was either specified at configure time or in
one of several possible environment variables.
--------------------------------------------------------------------------
make: *** [hello_c] Error 1

如果 ./configure 后面不加那些東西，就沒問題，mpirun -np 8 hello_c 也能正常顯示，但vasp編譯時(shí)候，到了mpi地方就出錯(cuò)。
很困惑，請(qǐng)高手指點(diǎn)。

用的是fftw-3.3.4 ，intel_intel_fortran_xe_2013, openmpi.1.10 (1.4版本也是這樣）。

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1樓 2016-03-13 20:41:16

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obaica

禁言 (著名寫手)

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

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2樓2016-03-13 21:27:19

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sin81

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這個(gè)加過，不加他安裝到默認(rèn)地址，但加跟不加結(jié)果一樣

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3樓2016-03-13 23:35:41

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迷路的游俠

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【答案】應(yīng)助回帖

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首先vasp編譯用不到openmpi，fftw-3.3.4 ，intel_intel_fortran_xe_2013就夠了。你要用openmpi的話編譯完要在環(huán)境變量里定義好。先看看which mpicc是哪個(gè)編譯器的。置于你說的mpirun正常是因?yàn)閕fort也有mpirun，openmpi也有mpirun命令，你要搞清楚你用的到底是啥

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4樓2016-03-15 09:32:02

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Ireson

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【答案】應(yīng)助回帖

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openmpi安裝的時(shí)候不需要限定這么多條件，F(xiàn)C=ifort就可以了。F77在新的openmpi里好像沒有了，用./configure --help看看，有的話就讓它等于ifort。其次，用openmpi安裝vasp當(dāng)然沒問題。不過我用16版的intel編譯器沒裝成功過VASP，openmpi倒是沒問題；用13版的就都成功了，感覺我這個(gè)問題是編譯的鍋。我的這個(gè)經(jīng)驗(yàn)可能對(duì)你有用

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5樓2016-03-15 21:10:12

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sin81

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謝謝，補(bǔ)充一下，我現(xiàn)在用的是2015版的intel編譯器，目前能成功編程出vasp（5.3版本），但運(yùn)行有誤，
顯示：forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image             PC             Routine          Line       Source
vasp             0000000000D5EF71  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000D5D6C7  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000CEEF74  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000CEED86  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000C9B40F  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000CA13CD  Unknown             Unknown  Unknown
libpthread.so.0 00002AB1D7336130  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000B6F110  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000B3E42D  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000B3EECE  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000B3EA32  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             000000000053E757  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             000000000054413B  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             0000000000431F7B  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             000000000040EA8E  Unknown             Unknown  Unknown
libc.so.6       00002AB1D81F9AF5  Unknown             Unknown  Unknown
vasp             000000000040E999  Unknown             Unknown  Unknown

用openmpi編譯也是同樣的問題，加或不加 -heap-arrays 64，都不行，設(shè)置OFLAG=-O1，或O2都不行。

請(qǐng)高手指教。謝謝！

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6樓2016-03-16 09:43:58

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magicmonk

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【答案】應(yīng)助回帖

最好把Makefile放上來

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我們最深的恐懼不是我們能力不夠，我們最深的恐懼是能力超越了極限。

7樓2016-03-17 10:28:04

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sin81

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為什么貼makefile會(huì)被屏蔽掉？？？

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8樓2016-03-17 12:57:50

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