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jackjiejl木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
VASP在深圳超算上如何做計(jì)算前 ，截?cái)嗄�，K點(diǎn)，晶格常數(shù)等測(cè)試 已有3人參與
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#!/bin/sh rm WAVECAR for i in 400 450 500 550 600 650 700 750 800 do cat > INCAR << ! SYSTEM=job_name ENCUT=$i ISTART=0; ICHARG=2 ISMEAR=-5 GGA=91 VOSKOWN=1 PREC=High ! echo "ENCUT= $i eV"; time vasp E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}'` echo $i $E >> comment done 這是在網(wǎng)上下載的腳本，大概應(yīng)該是侯博士的教程里面的，但是我不清楚這個(gè)腳本如何使用，我是在深圳超算上使用，需要對(duì)這個(gè)腳本添加什么呢，自己對(duì)程序這塊不懂，希望大家能指點(diǎn)一下， |
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2樓2016-03-15 10:25:24
cahndengbin
新蟲(chóng) (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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你要看下深圳超算系統(tǒng)里的一些命令。 例如我是在天河超算，就要把倒數(shù)第四行的time vasp改成 yhrun -N 1 -n 12 -p TH_NET1 vasp 其中-N表示指定節(jié)點(diǎn)數(shù)，-n表示指定進(jìn)程數(shù)，-p表示在哪個(gè)分區(qū)上算。 然后提交任務(wù)的時(shí)候用 yhbatch -N 1 -n 12 -p TH_NET1 ./run_encut.sh 大致是這個(gè)意思，你要仔細(xì)去看深圳超算系統(tǒng)的用戶(hù)手冊(cè)，那樣比在小木蟲(chóng)上問(wèn)清楚多了。 |
3樓2016-03-15 18:50:48
jackjiejl
木蟲(chóng) (小有名氣)
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4樓2016-03-16 11:11:13
5樓2016-03-24 12:24:50
【答案】應(yīng)助回帖
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這個(gè)例子只是一個(gè)測(cè)試截?cái)嗄艿哪_本，可以用類(lèi)似的腳本來(lái)測(cè)試截?cái)嗄�，k點(diǎn)，還有晶格參數(shù)，等等。在這個(gè)腳本后面需要加入你的vasp絕對(duì)運(yùn)行路徑，然后在提交任務(wù)腳本里指向這個(gè)測(cè)試腳本，輸出不同的測(cè)試值對(duì)應(yīng)的能量，選擇合適的截?cái)嗄��？梢阅７乱粋�(gè)例子來(lái)試一下 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶(hù)端 |
6樓2016-03-24 20:52:33
luzihen
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7樓2016-03-25 15:01:20
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