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wuxi_czy新蟲 (初入文壇)
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[求助]
Autodock活性中心由金屬離子和非標準氨基酸的對接 已有1人參與
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大家好， 最近我在對接金屬酶和它的底物時遇到了問題。受體是腈水合酶，活性中心由一個金屬鈷離子和兩個被氧化的半胱氨酸（非標準氨基酸）。對接過程沒有出錯，但是到了結(jié)果分析，一按interaction就會報錯 我把錯誤和原始文件上傳了 請大家?guī)臀铱纯丛趺刺幚磉@個問題 參數(shù)應該怎么修改呢 謝謝大家了 *Python Shell* Unable to assign HYB type to atom N Unable to assign HYB type to atom N Unable to assign HYB type to atom N ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/ViewerFramework/VF.py", line 929, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 3087, in doit self.build() File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 2922, in build self.buildLigandDisplay() File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 2788, in buildLigandDisplay self.vf.computeMSMS(lig, surfName, perMol=1, topCommand=0, display=self.showMsms.get()) AttributeError: MoleculeViewer instance has no attribute 'computeMSMS' Unable to assign HYB type to atom Co Unable to assign HYB type to atom N Unable to assign HYB type to atom N Unable to assign HYB type to atom N ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/ViewerFramework/VF.py", line 929, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 3087, in doit self.build() File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 2922, in build self.buildLigandDisplay() File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 2788, in buildLigandDisplay self.vf.computeMSMS(lig, surfName, perMol=1, topCommand=0, display=self.showMsms.get()) AttributeError: MoleculeViewer instance has no attribute 'computeMSMS' |
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2016-03-15 15:34:20, 163.45 K
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4樓2016-03-16 10:32:30
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