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fix nvt 體系為何會(huì)越來越大？ 已有1人參與
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做lammps模擬，大概是金屬板上面一層水，取的是p p fm邊界 用nvt跑平衡的時(shí)候，系統(tǒng)的體積會(huì)越來越大，總會(huì)有幾個(gè)水分子跑得很遠(yuǎn)很遠(yuǎn)，這是正常情況嗎？ 照理說nvt的話體積應(yīng)該恒定啊~~ 我看的文獻(xiàn)里并沒有提到這種現(xiàn)象，是我的邊界條件錯(cuò)誤了還是漏了些什么東西呢？ 參考的文獻(xiàn)是Martin Fitzner, Gabriele C. Sosso, Stephen J. Cox, et al. JACS.137,13658(2015) in文件： echo screen units real newton on dimension 3 boundary p p fm atom_style atomic region box block -30.00 30.00 -30.00 30.00 0.00 70.00 units box create_box 2 box lattice bcc 2.8665 region metel block INF INF INF INF 0.00 4.00 units lattice create_atoms 1 region metel lattice sc 3.15 region water block INF INF INF INF 13.50 48.50 units box create_atoms 2 region water mass 1 55.845 mass 2 18.01528 pair_style hybrid lj/cut 7.53 sw pair_coeff * * sw mW.sw NULL HOO pair_coeff 1 2 lj/cut 1.00 2.34 pair_coeff 1 1 none group M type 1 group W type 2 timestep 10 fix 1 M setforce 0.00 0.00 0.00 dump min all atom 100 min.lammpstrj minimize 1.0e-5 1.0e-6 10000 100000 undump min thermo 100 dump tmp all atom 10000 tmp1.lammpstrj fix 2 all nvt temp 290.0 290.0 500 tchain 10 run 1000000 undump tmp1 |
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5樓2016-04-13 10:35:38
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