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學(xué)術(shù)黃新蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
求問(wèn)多肽與核酸模擬結(jié)合的軟件！ 已有2人參與
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 我做的方向是多肽和核酸的結(jié)合，核酸的結(jié)構(gòu)可以下到，但是多肽結(jié)構(gòu)是沒(méi)有的。請(qǐng)問(wèn)哪些軟件可以預(yù)測(cè)多肽結(jié)構(gòu)？哪些軟件可以對(duì)結(jié)合做動(dòng)力學(xué)模擬？求問(wèn)~ |
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2樓2016-03-18 16:25:57
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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其實(shí)預(yù)期結(jié)果想準(zhǔn)確還是比較難，盡管現(xiàn)在軟件比較多。除非預(yù)先知道多肽的結(jié)果，可以首先用伸展構(gòu)想的多肽結(jié)構(gòu)試試，放在模擬過(guò)程中多肽結(jié)構(gòu)會(huì)變化。可以查文獻(xiàn)看看是否有相關(guān)軟件，比如 http://genesilico.pl/NPDock。 相應(yīng)文章見(jiàn)http://nar.oxfordjournals.org/co ... /14/nar.gkv493.full 當(dāng)然還有其他docking軟件可以，見(jiàn)上述文獻(xiàn)。 如果docking結(jié)構(gòu)符合你的要求，很多動(dòng)力學(xué)軟件都可以用，amber，gromacs，namd等等。 |
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學(xué)術(shù)黃3樓2016-03-21 18:38:43
學(xué)術(shù)黃
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4樓2016-03-21 18:55:01
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5樓2016-03-21 20:46:52
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6樓2016-03-22 09:34:35
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7樓2016-03-22 18:15:54
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