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單點(diǎn)能計(jì)算
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想知道怎樣去計(jì)算包合物的變形能，看到了前輩寫得貼，如下： "1）先對各個(gè)結(jié)構(gòu)進(jìn)行定義： 單獨(dú)優(yōu)化A，得到的結(jié)構(gòu)是A1，其能量為E(A1)；單獨(dú)優(yōu)化B，得到的結(jié)構(gòu)是B1，其能量為E(B1)。 優(yōu)化復(fù)合物AB，得到的結(jié)構(gòu)是X，對X進(jìn)行BSSE校正后，得到其能量為E(X)。 （2）然后在結(jié)構(gòu)X中，抽取原先屬于A的那些原子（也就是將原先屬于B的那些原子改成空原子Bq），計(jì)算單點(diǎn)能，得到E(A2);抽取原先屬于B的那些原子（也就是將原先屬于A的那些原子改成空原子Bq），計(jì)算單點(diǎn)能，得到E(B2)。" 想求教下下，“也就是將原先屬于B的那些原子改成空原子Bq”這句話具體對應(yīng)的操作？是把對應(yīng)的包合物里面B部分原子全部刪除么？ |
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