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Catherine-ru金蟲 (小有名氣)
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[交流]
PLCE1 mRNA和蛋白的表達與胃食管鱗狀細胞癌和胃腺癌患者的生存
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PLCE1 mRNA and protein expression and survival of patients with esophageal squamous cell carcinoma and gastric adenocarcinoma PLCE1 mRNA和蛋白的表達與胃食管鱗狀細胞癌和胃腺癌患者的生存 https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/24867265 PMID: 24867265 影響因子：4.125 GEO相關樣本：476（GSE29272、GSE23400） 物種：人 文章內容 背景： 在中國， PLCE1 (10q23)種系基因的變異已經(jīng)證明與 食管鱗狀細胞癌(ESCC)和胃癌的風險是一致相關的。在癌與正常配對組織中我們評估PLCE1 mRNA和蛋白的表達，和他們與生存的關系。 方法與結果： 在ESCC (n=132)的配對的癌與正常組織，胃賁門癌(GCA, n=62)和非賁門癌(GNCA, n=72)中，PLCE1 mRNA被用三種探針樣式的Affymetrix GeneChip U133芯片進行分析。我們在ESCC(n=303)配對的癌與正常組織和GCA (n=298)與GNCA (n=124)腫瘤用免疫組織化學從組織芯片上檢測PLCE1蛋白。 與正常組織相比，PLCE1 mRNA表達在ESCC 腫瘤中(P=0.03, probe_205112_at)是顯著減少的，在GCA和GNCA腫瘤(P<0.0001，each probe)中也是一樣。在ESCC腫瘤(P=0.51)中蛋白表達不是顯著地減少。在ESCC (對于最高的 vs 最低的四分位數(shù)9.6個月； P -trend=0.02)中，增強的腫瘤-正常的mRNA的fold change (probe_205112_at)是與更長的生存期密切相關的。增強的mRNA的腫瘤-正常fold change(probe_205111_at)是與GCA(對于最高的四分位數(shù)10.7 個月；P-trend =0.04)更長的生存期密切相關，但對于GNCA病例(P=0.72)卻不是。類似于mRNA，在ESCC中提高腫瘤-正常的蛋白的fold change也與提高生存率密切相關（對于最高的四分位數(shù)8.1個月，P -trend=0.02）。 結論： 在ESCC (one probe only) 和 GCA 腫瘤觀察PLCE1 mRNA表達的異常調節(jié)，并且這個變化的PLCE1表達看上去可能是和癌癥的預后相關的。PLCE1的潛在作用在ESCC 和GCA早期檢測和治療中需要進一步調查研究。 樣本信息 文章中共476個樣本，平臺支持的有374個樣本。食管鱗狀細胞癌與癌旁共106個，胃賁門癌與癌旁124個，非胃賁門癌與癌旁144個。 Affymetrix Human Genome U133 Array 食管鱗狀細胞癌(ESCC)：  胃賁門癌(GCA)：  非胃賁門癌(GNCA)：  推薦理由： 1. 文章中是分別對胃食管鱗狀細胞癌和胃腺癌的基因和蛋白層面進行了研究，兩個方面結合的研究結果會更加客觀可靠。 2. 對于胃食管鱗狀細胞癌、胃賁門癌和非胃賁門癌研究的文章比較多，本文是綜合了以上三者進行的研究，容易發(fā)現(xiàn)一些更有價值的信息。 分析實驗室 數(shù)據(jù)復用方案：分別將胃食管鱗狀細胞癌、胃賁門癌和非胃賁門癌的癌與癌旁的差異結果進行通路分析，可以從中發(fā)現(xiàn)PLCE1這個關鍵基因所在的信號通路。  史上最實在的買就送：ipad、iwatch、Kindle和迪士尼，你想要啥？ 是的  GCBI迎來了第一個周年慶 謝謝您的認可 我將繼續(xù)和您同在  請收下我的禮物  不過，請問你最想要哪個禮物呢？  活動詳見GCBI知識庫 |
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