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Catherine-ru金蟲 (小有名氣)
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[交流]
非吸煙肺癌女性中一個新的生物標志物--- SEMA5A
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Identification of a novel biomarker, SEMA5A, for non-small cell lung carcinoma in nonsmoking women 非吸煙肺癌女性中一個新的生物標志物--- SEMA5A https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/20802022 PMID：20802022 影響因子 ：4.125 GEO相關(guān)樣本: 120（GSE19804） 物種：人 主要內(nèi)容： 雖然吸煙是導(dǎo)致肺癌的高危因素，但是在臺灣地區(qū)僅有7%的女性肺癌患者有吸煙史。非吸煙患者的腫瘤發(fā)生機制尚未明確，但是信號素是被認為有抑制肺腫瘤作用。本文綜合分析了臺灣地區(qū)非吸煙女性肺癌患者的分子特征，特別是生物素基因家族。 本文使用Affymetrix U133plus2.0芯片檢測了60對癌癥和癌旁肺組織樣本。利用配對T檢驗篩選了腫瘤組織中的差異表達基因并且利用逆轉(zhuǎn)錄PCR和免疫組化進行了驗證。利用IPA進行了功能分析，基因富集分析和信號通路分析。利用kaplan-Meier生存分析評估了SEMA5A的表達和臨床結(jié)果關(guān)聯(lián)。 我們從非小細胞肺癌中篩選了687差異表達基因，其中大部分，特別是是生物素家族基因，參與了軸突導(dǎo)向信號通路。腫瘤組織中SEMA5A不管在轉(zhuǎn)錄水平還是翻譯水平都是低表達的，而且SEMA5A的低表達與非吸煙女性非小細胞肺癌的低生存率相關(guān)。 總之，一些生物素家族基因可以作為潛在的藥物作用靶點，SEMA5A基因可能成為非小細胞肺癌預(yù)后的一個有效的生物標志物，也可能代表臺灣地區(qū)病人的性別特異性。 樣本信息： 本文GEO相關(guān)樣本: 120例（GSE19804），為60對癌癥和癌旁的配對樣本。 臨床信息：  推薦理由： 1． 本文有60對肺癌的配對樣本，來自臺灣地區(qū)，為亞洲人群，更利于我們國內(nèi)利用； 2． PMID: 21935476也利用本文的120個樣本，和另一批SNP6.0芯片進行聯(lián)合分析。 3． PMID: 26656665也利用了這120個樣本，研究了MDK蛋白。 分析實驗室： 1. 本文中挑選出的基因為SEMA5A，可以利用網(wǎng)絡(luò)分析，研究該基因表達一致的基因群，進一步挖掘該基因的作用途徑。  史上最實在的買就送：ipad、iwatch、Kindle和迪士尼，你想要啥？ 是的 GCBI迎來了第一個周年慶 謝謝您的認可 我將繼續(xù)和您同在 請收下我的禮物 不過，請問你最想要哪個禮物呢？ 活動詳見GCBI知識庫 |
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