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Catherine-ru金蟲 (小有名氣)
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Association of Interleukin-28B Genotype and Hepatocellular Carcinoma Recurrence in Patients with Chronic Hepatitis C 白介素28B 基因型與慢性丙肝患者中的肝細(xì)胞癌復(fù)發(fā)的關(guān)聯(lián) https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/23426277 PMID: 23426277 影響因子：8.722 GEO相關(guān)樣本： GSE41804 物種：人 文章內(nèi)容 目的： 一些SNP在白介素28B (IL-28B)的位點最近已被證明是與慢性丙型肝炎(CHC)抗病毒治療療效有關(guān)。然而，我們研究的IL-28B基因型和接受藥物治療的肝細(xì)胞癌患者的生物學(xué)與臨床結(jié)果之間的關(guān)聯(lián)，這樣一個與肝細(xì)胞癌(HCC)的相關(guān)性是未知的�！� 方法與結(jié)果： 帶有慢性丙型肝炎的183例肝細(xì)胞癌患者的基因分型，他們是被通過肝切除或射頻消融(RFA)進(jìn)行處理的，并且結(jié)果分析用來確定IL-28B基因型(rs8099917)和臨床結(jié)果之間的關(guān)聯(lián)。20例肝細(xì)胞癌患者和另一部分的91名慢性丙型肝炎患者的基因表達(dá)被用微陣列和基因集富集分析。同時也進(jìn)行了組織學(xué)和免疫組織化學(xué)分析。 rs8099917基因型的TT、TG和GG比例分別是67.8%(124/183)，30.6%(56/183)，和1.6% (3 /183)。多變量Cox比例風(fēng)險分析表明IL-28B TT基因型是明顯的與HCC復(fù)發(fā)相關(guān)(P= 0.007；HR， 2.674； 95% 置信區(qū)間 1.16–2.63)。微陣列分析表明在肝臟樣本中干擾素刺激的基因與在IL-28B TG/GG基因型腫瘤組織的免疫相關(guān)基因高表達(dá)。組織學(xué)研究結(jié)果表明，在TG / GG基因型，更多的淋巴細(xì)胞滲透到腫瘤組織中。 結(jié)論： IL-28B基因型與CHC患者HCC復(fù)發(fā)、基因表達(dá)、和組織調(diào)查結(jié)果有關(guān)。 樣本信息 文章中共40個樣本。 Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array major minor 20 20 推薦理由： 1. 文中對本批數(shù)據(jù)只做了層次聚類分析和富集度分析，我們可以利用GCBI平臺現(xiàn)有的功能進(jìn)行更多的分析進(jìn)一步得到更可靠的結(jié)果。 分析實驗室 數(shù)據(jù)復(fù)用方案：分別將IL-28B rs8099917的TT基因型和TG/GG基因型的樣本的差異結(jié)果進(jìn)行通路分析，從中發(fā)現(xiàn)與肝癌相關(guān)的信號通路。 史上最實在的買就送：ipad、iwatch、Kindle和迪士尼，你想要啥？ 是的 GCBI迎來了第一個周年慶 謝謝您的認(rèn)可 我將繼續(xù)和您同在 請收下我的禮物 不過，請問你最想要哪個禮物呢？ 活動詳見GCBI知識庫 |
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