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人人余yan金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
求教：聲子譜數(shù)據(jù)處理 Traceback (most recent call last): 已有1人參與
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在虛擬機(jī)上處理聲子譜 ，phonopy -f {001..588}/vasprun.xml之后出現(xiàn)下面的問(wèn)題，對(duì)程序這些不懂，希望蟲(chóng)友幫忙解決一下 提示如下： xu@xu-VirtualBox:~/workplace/export$ phonopy -f {001..588}/vasprun.xml _ _ __ | |__ ___ _ __ ___ _ __ _ _ | '_ \| '_ \ / _ \| '_ \ / _ \ | '_ \| | | | | |_) | | | | (_) | | | | (_) || |_) | |_| | | .__/|_| |_|\___/|_| |_|\___(_) .__/ \__, | |_| |_| |___/ 1.10.0 counter (file index): 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 Traceback (most recent call last): File "/home/xu/opt/phonopy-1.10.0/bin/phonopy", line 533, in <module> log_level) File "/home/xu/opt/phonopy-1.10.0/lib/python/phonopy/interface/__init__.py", line 135, in create_FORCE_SETS is_zero_point=options.force_sets_zero_mode) File "/home/xu/opt/phonopy-1.10.0/lib/python/phonopy/interface/vasp.py", line 83, in parse_set_of_forces _iterparse(force_files, tag='varray')) File "/home/xu/opt/phonopy-1.10.0/lib/python/phonopy/interface/vasp.py", line 554, in _get_forces_vasprun_xml for event, element in vasprun: File "/home/xu/opt/phonopy-1.10.0/lib/python/phonopy/interface/vasp.py", line 532, in _iterparse for event, elem in etree.iterparse(fname): File "<string>", line 107, in next cElementTree.ParseError: no element found: line 678, column 0 |
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7樓2016-04-12 20:20:07
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2樓2016-04-03 10:36:38
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送紅花一朵 |
127和127沒(méi)有問(wèn)題，有一個(gè)沒(méi)有算完，又重新提了一下，但之前沒(méi)算完處理的時(shí)候提示不是這樣的，具體還要算完在看一下，感謝回復(fù) 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
3樓2016-04-03 11:19:55
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5樓2016-04-05 11:57:57
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