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declanzh1234

銀蟲 (初入文壇)

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專業(yè): 水產(chǎn)生物遺傳育種學(xué)

[求助] miRNA靶基因驗(yàn)證3'UTR 已有1人參與

如上要進(jìn)行miRNA靶基因驗(yàn)證，在擴(kuò)靶基因3'UTR時(shí)發(fā)現(xiàn)ensembl上3'UTR要比NCBI長(zhǎng)好多，而miRNA種子區(qū)在ensembl3'UTR內(nèi)，卻沒在NCBI上3'UTR內(nèi)，求指導(dǎo)謝謝。

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271材料工程求調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)

1樓 2016-04-04 23:47:01

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

孤單的鞋

新蟲 (初入文壇)

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專業(yè): 生物化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

靶基因3'UTR在ensembl上3'UTR內(nèi)就擴(kuò)ensembl上3'UTR部分啊，不然你的miRNA怎么結(jié)合，你得先把靶基因所在的細(xì)胞或者組織里提取全基因組序列，然后擴(kuò)增你的靶向結(jié)合3‘UTR。NCBI上的靶基因有可能只顯示CDS區(qū)，沒有3’UTR?不知道我說明白沒

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2樓2016-07-14 10:59:01