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younggood

銅蟲(chóng) (小有名氣)

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[求助] 降低能壘已有1人參與

我用高斯b3lyp方法找到了一個(gè)過(guò)渡態(tài)，用irc找到反應(yīng)物后，用了b3lyp方法加溶劑甲醇做單點(diǎn)，結(jié)果，反應(yīng)物到過(guò)渡態(tài)的能壘相差很大，有47kcal/mol,因?yàn)槎叩膅ibbs差別不是很大，而加上溶劑化效應(yīng)后的單點(diǎn)能才很大，我認(rèn)為的是我的溶劑化效應(yīng)的方法有問(wèn)題，我又嘗試了其它方法b3lypD3,M06方法算溶劑化效應(yīng)，結(jié)果能壘只是降低了1-2kcal/mol，請(qǐng)問(wèn)各位大神，我作溶劑化效應(yīng)單點(diǎn)時(shí)用什么方法能讓能壘降低呢，因?yàn)橐恢睕](méi)有辦法降低這個(gè)高的能壘，想聽(tīng)聽(tīng)你們的建議，非常感謝

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1樓 2016-04-08 11:17:58

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1989shaonan

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
younggood: 金幣+10, ★有幫助 2016-04-11 10:44:09

引用回帖:

3樓: Originally posted by younggood at 2016-04-10 21:13:15
哦，是這樣的，我是溶劑中優(yōu)化找過(guò)渡態(tài)+溶劑單點(diǎn)能，而溶劑優(yōu)化找過(guò)渡態(tài)的反應(yīng)物和過(guò)渡態(tài)gibbs差別很小，而加上溶劑化效應(yīng)后的單點(diǎn)能才很大，請(qǐng)問(wèn)是怎么回事呢...

1. 這就是主體溶劑效應(yīng)的影響。對(duì)于你在溶劑化中優(yōu)化的反應(yīng)物和過(guò)渡態(tài)，直接作單點(diǎn)得到活化能Δ E, 在溶劑化中作單點(diǎn)得到活化能Δ E(aq)，兩者有差異是正常的。以前的做法通常是“氣相優(yōu)化+溶劑化單點(diǎn)”，現(xiàn)在計(jì)算能力提高了，就采用”溶劑優(yōu)化+溶劑化單點(diǎn)“，一般在計(jì)算單點(diǎn)能時(shí)還是要考慮溶劑化效應(yīng)；
2. 如果你采用溶劑化單點(diǎn)能得到的活化能與實(shí)驗(yàn)值相差很大，一個(gè)可能的原因是真實(shí)溶劑效應(yīng)（即溶質(zhì)周圍的甲醇分子）有實(shí)質(zhì)性影響�？梢試L試在溶質(zhì)周圍排布幾個(gè)甲醇分子，然后”直接優(yōu)化+溶劑化單點(diǎn)“，或”溶劑優(yōu)化+溶劑化單點(diǎn)“。

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4樓2016-04-11 01:16:06

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1989shaonan

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1. 溶劑效應(yīng)本身會(huì)影響反應(yīng)的電子活化能。你采用的計(jì)算方法大概是：氣相優(yōu)化+溶劑單點(diǎn)能。溶劑單點(diǎn)能得到的活化能與氣相得到的活化能有差異是正常的，改變基組、泛函對(duì)不會(huì)有大的改變；
2. 如果體系不大，可以在溶劑化中進(jìn)行過(guò)渡態(tài)優(yōu)化、irc計(jì)算和反應(yīng)物優(yōu)化，然后再進(jìn)行溶劑單點(diǎn)計(jì)算。

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2樓2016-04-09 10:03:31

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引用回帖:

2樓: Originally posted by 1989shaonan at 2016-04-09 10:03:31
1. 溶劑效應(yīng)本身會(huì)影響反應(yīng)的電子活化能。你采用的計(jì)算方法大概是：氣相優(yōu)化+溶劑單點(diǎn)能。溶劑單點(diǎn)能得到的活化能與氣相得到的活化能有差異是正常的，改變基組、泛函對(duì)不會(huì)有大的改變；
2. 如果體系不大，可以在溶 ...

哦，是這樣的，我是溶劑中優(yōu)化找過(guò)渡態(tài)+溶劑單點(diǎn)能，而溶劑優(yōu)化找過(guò)渡態(tài)的反應(yīng)物和過(guò)渡態(tài)gibbs差別很小，而加上溶劑化效應(yīng)后的單點(diǎn)能才很大，請(qǐng)問(wèn)是怎么回事呢

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3樓2016-04-10 21:13:15

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引用回帖:

4樓: Originally posted by 1989shaonan at 2016-04-11 01:16:06
1. 這就是主體溶劑效應(yīng)的影響。對(duì)于你在溶劑化中優(yōu)化的反應(yīng)物和過(guò)渡態(tài)，直接作單點(diǎn)得到活化能Δ E, 在溶劑化中作單點(diǎn)得到活化能Δ E(aq)，兩者有差異是正常的。以前的做法通常是“氣相優(yōu)化+溶劑化單點(diǎn)”，現(xiàn)在計(jì)算 ...

哦哦，我先試試把甲醇和它們放在一起優(yōu)化吧，謝謝了

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5樓2016-04-11 10:45:07

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