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[求助]
gromacs5.1在服務(wù)器上的安裝問(wèn)題 已有2人參與
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樓主是linux和gromacs雙料小白，很不幸要摸索如何在服務(wù)器上以普通用戶安裝gmx-5.1（同時(shí)服務(wù)器/usr/local/gromacs 已經(jīng)存在一個(gè)4.6版本的GMX） 我在自己的home目錄下下載并解壓了gmx-5.1 tar xfz gromacs-5.1.2.tar.gz cd gromacs-5.1.2 mkdir build cd build cmake .. -DCAME_INSTALL_PREFIX=/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2 -DGMX_MPI=ON -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON make -j make install 一直到make -j都沒(méi)有什么問(wèn)題，如下： [xncao@login_node build]$ make -j [ 1%] Built target fftwBuild [ 1%] Built target view_objlib [ 1%] Built target mdrun_objlib [ 98%] Built target libgromacs [100%] [100%] Built target gmx Built target template [xncao@login_node build]$ 但是make install以后就有如下報(bào)錯(cuò)： [xncao@login_node build]$ make install [ 1%] Built target fftwBuild [ 98%] Built target libgromacs [100%] Built target template [100%] Built target mdrun_objlib [100%] Built target view_objlib [100%] Built target gmx Install the project... -- Install configuration: "Release" -- Installing: /usr/local/gromacs/share/gromacs/COPYING CMake Error at cmake_install.cmake:36 (FILE): file INSTALL cannot copy file "/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2/COPYING" to "/usr/local/gromacs/share/gromacs/COPYING". make: *** [install] Error 1 我試圖刪除或者手動(dòng)替換/usr/local/gromacs/share/gromacs目錄中的COPYING，但是并沒(méi)有權(quán)限。。。 求問(wèn)大家：1.我已經(jīng)使用 -DCAME_INSTALL_PREFIX=/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2 試圖修改安裝位置了，為什么還是在/usr/local/gromacs/share/gromacs/中安裝呢？ 2.我應(yīng)該如何做才能把gmx-5.1.2安裝在我home目錄下？（或者其他目錄下，只要不與4.6沖突，能使用就行） |
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2樓2016-05-05 12:12:34
arixxl
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- 專(zhuān)業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
3樓2016-05-14 20:56:13
cuoce
木蟲(chóng) (小有名氣)
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- 注冊(cè): 2011-09-30
- 專(zhuān)業(yè): 色譜分析
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你好，我想用cygwin安裝gromacs，安裝過(guò)程如下： 將安裝包拷貝到了home/xing里面； tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz cd cmake-3.6.2 ./bootstrap 運(yùn)行一段時(shí)間之后出現(xiàn)如下問(wèn)題： CMake Error: Could not find CMAKE_ROOT !!! CMake has most likely not been installed correctly. Modules directory not found in /home/xing/cmake-3.6.2 CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting. --------------------------------------------- Error when bootstrapping CMake: Problem while running initial CMake --------------------------------------------- 請(qǐng)問(wèn)這個(gè)問(wèn)題該如何解決��？ |
4樓2017-10-22 21:54:21
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