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小木蟲論壇-學術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » 關(guān)于MS建模
| 查看: 1710 | 回復: 13 | ||||
[求助]
關(guān)于MS建模 已有1人參與
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| 需要RDX、HMX、TATB的CIF文件，我可以怎么找到或者有沒有朋友有現(xiàn)成的可以發(fā)我呢？我還有一個疑問就是我們在做分子動力學計算建模時只能根據(jù)CIF文件建模嗎，有沒有其他方法？ |
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4樓2016-05-11 09:35:42
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
li李曉曉: 金幣+5, ★★★很有幫助 2016-05-11 10:41:40
li李曉曉: 金幣+5, ★★★很有幫助 2016-05-11 10:41:40
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構(gòu)建晶體，你這樣的做法肯定是錯誤的。 晶體的各種參數(shù)，都是有專門的數(shù)據(jù)庫供查找的。 無機晶體，常用 ICSD數(shù)據(jù)庫；有機晶體，常用CCDC數(shù)據(jù)庫。 在這些數(shù)據(jù)庫中，找到想要晶體的信息之后，有兩種方式建模： 一種，直接導出cif文件，導入到MS中，檢查導入無誤，即可； 另一種，在MS中build crystal，手動輸入空間群、6個晶格常數(shù)，再 add atoms 輸入各原子坐標，即可完成。 |
6樓2016-05-11 10:16:41
月只藍
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10樓2016-05-11 11:39:21
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