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%rwf=a1,40gb,a2,20gb
%nosave
%chk=test.chk
%mem=50GB
%nprocshared=12
# B3LYP/6-311+g(2d,p) opt=(MaxCycle=500)
   。。。。。。

radGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
NTrRot= -1 NTRed= 124 NAtoms= 14 NSkip= 88 IsLin=F
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /data2/G09/g09/l103.exe at Mon May 16 12:25:19 2016.
Job cpu time:  0 days  6 hours 17 minutes 55.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    37 Int=    0 D2E=    0 Chk=    5 Scr=    1

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2016-05-16 16:29:52, 2.74 M

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1樓 2016-05-16 16:32:57

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

引用回帖:

3樓: Originally posted by byyd at 2016-05-16 19:28:31
能麻煩你給個正確的不？我問了下學(xué)化學(xué)的同學(xué)，他們說沒錯～～～
...

你的結(jié)構(gòu)應(yīng)該沒錯，如果這是HOOC-COOH與兩個CH3OH脂化得到的話。
問題是你畫的結(jié)構(gòu)有問題，羧基中的OCO并不是直角，你用GV畫一個羧基就知道了。

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4樓2016-05-17 12:34:23

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三石草祭

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5樓2016-05-17 15:26:19

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看了你log文件分子輸入坐標(biāo)，完全不正確，原子定位不正確，兩個CH3連到羰基O上了，不是你預(yù)想的結(jié)構(gòu)。要重新擬定。

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2樓2016-05-16 17:57:56

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引用回帖:

2樓: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-16 17:57:56
看了你log文件分子輸入坐標(biāo)，完全不正確，原子定位不正確，兩個CH3連到羰基O上了，不是你預(yù)想的結(jié)構(gòu)。要重新擬定。

能麻煩你給個正確的不？我問了下學(xué)化學(xué)的同學(xué)，他們說沒錯～～～

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3樓2016-05-16 19:28:31

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

試擬了一個輸入，在此基礎(chǔ)上進一步優(yōu)化，供參考。

# opt b3lyp/6-311+g(2d,p)

(cooch3)2

0 1
C                -3.22716001 -1.20431183 -0.22525487
C                -2.11644172 -1.33237946 0.83375578
O                -3.72487015 -2.37179296 -0.88417249
O                -1.58276853 -2.61878021 1.15820307
O                -3.69679060 -0.07227889 -0.51077035
O                -1.67845861 -0.30499635 1.41360516
C                -1.65885868 -3.46948922 0.01129224
H                -0.82938075 -3.53310297 -0.66162652
H                -2.51316808 -4.09781611 -0.13104806
H                -1.21395256 -4.24996638 0.59250990
C                -4.82445043 -2.90572526 -0.14205423
H                -4.49758585 -3.16439608 0.84341467
H                -5.60166539 -2.17300041 -0.07919557
H                -5.19686291 -3.77929505 -0.63509049

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6樓2016-05-17 16:39:49

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5樓: Originally posted by 三石草祭 at 2016-05-17 15:26:19
建議先clean用力場初步優(yōu)化結(jié)構(gòu)

剛接觸，不知道怎么弄，我用重新畫啦下圖，我在試試看

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7樓2016-05-17 16:48:22

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我從新做的圖，對不

(cooch3)2 優(yōu)化結(jié)構(gòu) 剛接觸，不知道是結(jié)構(gòu)式出錯還是？？？-1

}}K)J}@Z463R7R}M)8FTPR3.png

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8樓2016-05-17 16:57:55

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8樓: Originally posted by byyd at 2016-05-17 16:57:55
我從新做的圖，對不

}}K)J}@Z463R7R}M)8FTPR3.png
...

此結(jié)構(gòu)合理，這是反式，我那個是順式。

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9樓2016-05-17 18:11:39

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9樓: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-17 18:11:39
此結(jié)構(gòu)合理，這是反式，我那個是順式。...

按我新畫的結(jié)構(gòu)運行啦，結(jié)果出錯，我在試試你的構(gòu)型看看

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10樓2016-05-17 18:30:22

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