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新手已上路木蟲 (職業(yè)作家)
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清華大學(xué)發(fā)表合成生物學(xué)重要成果:邁出構(gòu)造鏡像生命體征途的關(guān)鍵 已有1人參與
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北京時(shí)間5月17日凌晨,Nature Chemistry 雜志在線發(fā)表了清華大學(xué)朱聽團(tuán)隊(duì)的最新合成生物學(xué)研究成果。他的團(tuán)隊(duì)構(gòu)造出了某一蛋白的鏡像版本,該蛋白在兩個(gè)最基本的生命學(xué)過程里行使重要功能:參與復(fù)制DNA,并將其轉(zhuǎn)錄成RNA。 朱聽博士階段的導(dǎo)師、2009年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)得主、哈佛醫(yī)學(xué)院的分子生物學(xué)家Jack Szostak說,這項(xiàng)工作代表著科學(xué)家在制作鏡像生命形式的路上邁出了“一小步”。他哈佛的同事 George Church認(rèn)為這項(xiàng)研究成果是了不起的里程碑,他希望有一天能構(gòu)建出完整的鏡像細(xì)胞。 許多有機(jī)分子是“有手性”的,它們以不可重疊的鏡像形式存在,就像左右手的手套那樣。但生命卻幾乎總是使用其中的一個(gè)形式,比如細(xì)胞利用的是左旋的氨基酸,DNA扭轉(zhuǎn)成的則是如右旋螺絲釘樣的結(jié)構(gòu)。 原則上來說,這些分子的鏡面版本(looking-glass versions)應(yīng)以同樣的方式與其普通版本一起工作,但它們或可以抵抗那些在鏡像世界里還未進(jìn)化成熟的常規(guī)病毒或酶的攻擊。 這使鏡像生物化學(xué)的研究變得有利可圖,抱有該希望的公司之一是位于柏林的Noxxon醫(yī)藥公司。它使用繁瑣的化學(xué)合成方法去制備 短鏈DNA或RNA的鏡像形式,使其結(jié)合到體內(nèi)蛋白質(zhì)的治療靶點(diǎn)上以阻斷其活性,這類鏡像形式被稱為“核酸適配體”(aptamers)。該公司目前已有多個(gè)鏡像適配體候選物,應(yīng)用在包括癌癥在內(nèi)的人體疾病臨床試驗(yàn)中。 鏡像適配體不會(huì)被體內(nèi)的酶降解,其功效也可得以加強(qiáng)。Noxxon制藥公司的首席科學(xué)官Sven Klussmann說,復(fù)制鏡像DNA的方法為制備鏡像適配體提供了一個(gè)更容易的途徑。 數(shù)十年以來研究人員已制備出大量的鏡像DNA,所以清華大學(xué)的團(tuán)隊(duì)可以從化學(xué)品供應(yīng)商那里得到他們所需要的足夠多的鏡像DNA,并用于他們鏡面DNA復(fù)制的研究。這類商品例如,目的鏡像DNA的一條鏈、鏡像DNA結(jié)構(gòu)單元,和可按正確順序延伸這些結(jié)構(gòu)單元的較短的鏡像“引物”鏈。 但比較困難的工作是制備與鏡像DNA復(fù)制過程相配合的鏡像酶,即DNA聚合酶,它可能需要使用右旋氨基酸合成得到,但常用的聚合酶有600多個(gè)氨基酸,對(duì)當(dāng)前的合成技術(shù)來說,該蛋白質(zhì)太大了。 所以,清華大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)轉(zhuǎn)向使用已知的最小的聚合酶:只有174個(gè)氨基酸的非洲豬瘟病毒聚合酶X!翱赡苷?yàn)樵摼酆厦感,它?fù)制DNA的速度也特別的慢!敝炻犝f,他領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)制備出了該DNA聚合酶的鏡像版本,發(fā)現(xiàn)像它的天然版本那樣,在大約四個(gè)小時(shí)的時(shí)間里,它能將12個(gè)核苷酸(DNA結(jié)構(gòu)單元)大小的鏡像引物延伸成18個(gè)核苷酸的鏡像DNA鏈,并在36小時(shí)內(nèi)將其延伸成56個(gè)核苷酸的DNA鏈。 在同一試管內(nèi),把該系統(tǒng)的普通版本和鏡像版本混合在一起時(shí),兩個(gè)版本的DNA復(fù)制過程可以互不干擾地獨(dú)立進(jìn)行。該鏡像聚合酶也可以將鏡像DNA轉(zhuǎn)錄為鏡像RNA,其轉(zhuǎn)錄速度同樣非常緩慢。 Klussmann表示Noxxon醫(yī)藥公司對(duì)使用更高效的酶完成類似的目的非常感興趣。事實(shí)上,接下來朱聽和他的同事們希望構(gòu)建出Dpo4聚合酶的鏡像結(jié)構(gòu)。該聚合酶由352個(gè)氨基酸組成,其DNA復(fù)制效率更高。 此外,清華大學(xué)的研究人員在他們的論文中試圖去探索為什么生命存在“手性”這回事。這依舊是個(gè)神秘的領(lǐng)域:它可能僅僅是偶然,也可能是由自然界中廣泛存在的根本的不對(duì)稱性所引發(fā)。 佛羅里達(dá)州應(yīng)用分子進(jìn)化基金會(huì)的Steven Benner表示,構(gòu)建生化生命的鏡像形式很難對(duì)闡明這個(gè)問題有所幫助。幾乎所有物理過程 如果在鏡子中觀察都是相同的,目前已知的只有一個(gè)例外,即亞原子物理領(lǐng)域的“宇稱不守恒”(parity violation),而這種微小的差異絕不會(huì)在這些生化實(shí)驗(yàn)中呈現(xiàn)出來。(構(gòu)建不被天然酶或病毒降解的DNA,Benner也很感興趣,但他并未使用鏡像DNA,他構(gòu)造的是一種非天然結(jié)構(gòu)單元的人造DNA)。 George Church的構(gòu)造鏡像細(xì)胞的終極目標(biāo)面臨著巨大的挑戰(zhàn)。自然界中,RNA由核糖體翻譯成蛋白質(zhì),而核糖體是一類非常復(fù)雜的分子機(jī)器。 朱聽說:“再造核糖體的鏡像結(jié)構(gòu)將是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)! George Church正試著制備正常核糖體的突變體,使它能夠與鏡像RNA作用并最終將其翻譯成蛋白質(zhì)。 George Church表示,沒有人能知道到底哪種方法能達(dá)成目標(biāo)。但越來越多的研究人員開始從事生化過程的鏡面版本的研究!耙郧昂荛L一段時(shí)間這個(gè)領(lǐng)域無人問津,但現(xiàn)在看來已發(fā)展的活力十足。” 作者:頭條號(hào) / 賽先生 鏈接:http://toutiao.com/a6285477089727152386/ 來源:頭條號(hào)(今日頭條旗下創(chuàng)作平臺(tái)) 著作權(quán)歸作者所有。商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系作者獲得授權(quán),非商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。 |


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