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mystao新蟲(chóng) (初入文壇)
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差異分析時(shí)，基因foldchange很大，但是統(tǒng)計(jì)學(xué)不顯著
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在用二代測(cè)序數(shù)據(jù)fpkm或者readcounts進(jìn)行差異分析的時(shí)候，基因的表達(dá)豐度并不低的情況下，為什么會(huì)出現(xiàn)基因foldchange很大，但是統(tǒng)計(jì)學(xué)不顯著p值不顯著的情況？，統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性理論上就是檢驗(yàn)表達(dá)差異性的，foldchange差異很大的情況，p-value應(yīng)該很小才對(duì)，求解，謝謝��！舉例如下(cuffdiff 結(jié)果，DESeq也有類(lèi)似情況)： transcript_id gene_id gene_name gene_location KO_FPKM WT_FPKM log2(foldchange) pvalue qvalue ENSMUST00000115118 ENSMUSG00000031095 Cul4b chrX:38533273-38576196 2.01117 10.7411 -2.41703 0.07125 0.999514 |
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新蟲(chóng) (小有名氣)
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2樓2016-11-25 19:25:41
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