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cyt160新蟲(chóng) (初入文壇)
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最近審稿回來(lái)reviewer有個(gè)問(wèn)題不知道怎么回答�。�！ 已有1人參與
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最近審稿回來(lái)reviewer有個(gè)問(wèn)題不知道怎么回答： 我是用16s rRNA miseq高通量測(cè)序測(cè)的五氯酚（PCP）降解過(guò)程中微生物群落的變化，我們做高通量的結(jié)果通常都是用相對(duì)豐度的變化來(lái)表示某個(gè)屬的變化，看reviewer意思需要其他定量結(jié)果，之前投的文章也沒(méi)有遇過(guò)種問(wèn)題，因?yàn)楦咄康慕Y(jié)果用相對(duì)豐度表示都是比較被認(rèn)可的，所以我也不想補(bǔ)定量的實(shí)驗(yàn)，想問(wèn)一下大家這么問(wèn)題要怎么回答才能讓reviewer比較滿意，謝謝！  問(wèn)題如下： The authors argue some particular bacteria are enriched in the microcosm spiked with PCP by comparison of relative abundance of the bacteria within prokaryote. However, there is no data about total population of bacteria in the microcosm. Without the data of total population or quantitative monitoring of the target bacteria, we cannot know the bacteria increased in the microcosm or not. |
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cyt160
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rainboy3529
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4樓2016-07-13 00:15:39
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5樓2016-07-13 23:08:37
cyt160
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6樓2016-07-13 23:10:42
rainboy3529
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7樓2016-07-13 23:52:24
fengjunchen
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| 審稿人的意見(jiàn)沒(méi)問(wèn)題，高通量測(cè)序確實(shí)不太好定量。我這邊師兄做群落分析的文章，是 培養(yǎng)法+Fish+二代測(cè)序 的套路，就沒(méi)這問(wèn)題。至于問(wèn)題的回答，不想補(bǔ)實(shí)驗(yàn)的話，就只能多多列舉別人的文章引證了；若是有心補(bǔ)實(shí)驗(yàn)的話，可以做個(gè)細(xì)菌通用引物的FISH或真菌的，看你的主要關(guān)注點(diǎn)，或者做個(gè)你最關(guān)注的那一種菌的功能基因基因組拷貝數(shù)的qPCR。 |
8樓2016-07-14 09:29:32
cyt160
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9樓2016-07-16 18:15:42
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