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細(xì)胞凋亡檢測之選擇指南
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當(dāng)細(xì)胞死亡時,研究人員往往會奮力排查死亡原因。他們采用各種分析,來確定細(xì)胞是經(jīng)歷了凋亡(apoptosis)、壞死(necrosis),還是程序性壞死(necroptosis),從而判斷特定環(huán)境是否有毒,或者確定藥物的作用機制。 凋亡是個復(fù)雜的過程,至少有兩種主要途徑 – 內(nèi)在和外在 – 導(dǎo)致了程序性細(xì)胞死亡。它們匯集于caspase蛋白酶級聯(lián)反應(yīng),最終破壞重要的細(xì)胞蛋白。確定哪條途徑被觸發(fā),在哪個步驟被阻斷,以及抑制劑是否能夠抑制,催生了各式各樣的凋亡檢測。 它凋亡了嗎? 人們以不同的凋亡標(biāo)志物為基礎(chǔ),開發(fā)了通用的凋亡檢測,這些產(chǎn)品可單獨或聯(lián)合使用。形態(tài)變化,如細(xì)胞皺縮和細(xì)胞膜起泡,可在顯微鏡下觀察。磷脂酰絲氨酸從內(nèi)測翻轉(zhuǎn)到細(xì)胞膜外側(cè),則可以通過Annexin V來檢測。通過TUNEL檢測來標(biāo)記帶切口的DNA,可觀察染色體降解。caspase級聯(lián)反應(yīng)的激活則通過caspase及其產(chǎn)物的分析來實現(xiàn)。具體選擇哪一種,這取決于多個因素,包括細(xì)胞類型和樣品量、現(xiàn)有的設(shè)備和經(jīng)驗。 醫(yī)生通常并不關(guān)心哪些途徑或分子被觸發(fā)或阻斷,因為在開藥之前,研究工作已經(jīng)做了。而這些細(xì)節(jié)正是研究人員想要確定的。 Caspase檢測 caspase作為酶原,始終存在于細(xì)胞中。一些酶,如執(zhí)行者caspase 3和caspase 7,是組成型的二聚體,必須經(jīng)過切割和重排,才能形成活性位點。另一些酶,如啟動者caspase 8、9和10,是組成型單體,它們只有二聚化并招募到多蛋白復(fù)合物之后才激活1。 針對大多數(shù)感興趣的caspase,市場上已經(jīng)有了抗體。不過,由于caspase是組成型的,必須利用試劑來辨別活性和非活性形式,才能判斷它們是否參與了凋亡。抗體這種關(guān)鍵的試劑可用于各種檢測,包括流式分析、免疫組化、ELISA、Western blot和免疫熒光。 許多分析檢測caspase酶的活性,而不是酶本身。“有一些底物被caspase酶普遍切割,如PARP和核纖層蛋白,而我們有特異針對那些切割產(chǎn)物的抗體,”Cell Signaling Technology(CST)的產(chǎn)品開發(fā)專員Gary Kasof說。其他底物只被單個或少數(shù)幾個caspase切割。 當(dāng)然,市場上也有并非基于抗體的檢測。例如,許多廠商推出了廣泛和特定的caspase試劑盒,基于FLICA(熒光標(biāo)記的caspase抑制劑)檢測,其中小小的熒光分子穿過活細(xì)胞膜,不可逆地與caspase活性位點結(jié)合,而未結(jié)合的試劑被洗掉。相同的概念已被用于PET探針,其中F-18 PET標(biāo)記取代了熒光。 另一個選擇是使用一種細(xì)胞系,它缺少了你感興趣的特定caspase基因!叭绻芯咳藛T認(rèn)為,他們已經(jīng)開發(fā)出一種藥物,觸發(fā)了癌細(xì)胞的凋亡,那么,這是一種快速而簡單的方法,來評估新藥是否通過這個途徑起作用,”Horizon Discovery的腫瘤項目經(jīng)理Nicola McCarthy談道,這家公司提供了一些單倍體caspase敲除產(chǎn)品。 除此之外 “我們也有其他的單倍體細(xì)胞系,它們?nèi)笔Я说蛲鐾緩降母鞣N組分,”McCarthy補充道。 “如果你只是對下游的caspase家族成員感興趣(這個家族至少有12種獨特的caspase蛋白),你將看到幾乎所有凋亡途徑的融合,”Bio-Rad公司Bio-Plex產(chǎn)品的全球產(chǎn)品經(jīng)理Daniel Braunschweig說。 不過,如果你只研究caspase,你也許會錯過內(nèi)在途徑調(diào)控的凋亡。“癌癥中缺乏凋亡,而神經(jīng)退行性疾病或心臟病的過度凋亡,往往是通過Bcl-2家族成員實現(xiàn)的!被谶@個原因,Braunschweig表示,Bio-Rad Bio-Plex(基于Luminex)凋亡產(chǎn)品的重點放在Bcl-2家族。他認(rèn)為,單一的標(biāo)志物往往不足以清楚認(rèn)識凋亡背后的機制。 “每當(dāng)你想確定一個治療方案是否起作用,或者給疾病分期,你總是需要多個標(biāo)志物,”BioVision的技術(shù)支持專家Sunetra Ray談道。也許這解釋了流式細(xì)胞儀為何在凋亡研究中廣泛使用。 對于與凋亡內(nèi)在和外在途徑相互作用的其他分子和通路,人們最近也表現(xiàn)出濃厚的興趣。這包括凋亡抑制劑(IAP)家族和SMAC(IAP的抑制劑),它們的小分子模擬物已被開發(fā)出,以促進癌癥中的細(xì)胞凋亡。 了解凋亡,有許多方式,從通用的(它是否發(fā)生?)到特異的(針對caspase 9和Bax)。你需要仔細(xì)選擇。它可是關(guān)乎細(xì)胞生死的問題。 |
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