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時(shí)光檢索金蟲 (小有名氣)
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[求助]
提問：小RNA
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做擬南芥micro-RNA測序，提供樣品，公司建庫，測序。第一次，長度分布圖顯示30-40nt的較多，測序比對結(jié)果都顯示與已知RNA比對率低3%-5%（mapping率低？）。公司懷疑我們實(shí)驗(yàn)室自己抽提的RNA質(zhì)量不好。第二次直接植物樣品，結(jié)果長度分布正常了，但是測序比對結(jié)果都顯示與已知RNA比對率低10%左右。實(shí)驗(yàn)組，對照組都有重復(fù)，都是這個(gè)結(jié)果。 請問：這最有可能是哪步出問題了？測出來很多未知的正常嗎？這樣的結(jié)果正常嗎？擬南芥正常的mapping率在多少結(jié)果正常呢？ 十分感謝，希望大家給出寶貴建議 圖片2.png 圖片1.png@biostar2009@飛約瘋?cè)嗽?/u> |
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2樓2016-09-19 23:29:03
時(shí)光檢索
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3樓2016-09-20 00:03:22
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4樓2016-09-20 08:25:34
5樓2016-09-20 10:54:14
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