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0502114073木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
高斯優(yōu)化中，能否固定一部分，而只優(yōu)化另外一部分呢？
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| 比如石墨烯吸附CO，我怎么固定石墨烯，只優(yōu)化CO分子，請(qǐng)教各位高手，謝謝�。� |
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小范范1989
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2樓2016-09-26 08:32:05
0502114073
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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您的意思 直接在坐標(biāo)和元素符號(hào)之間寫(xiě)-1，比如下面例子Fe(NH2)4 我要固定一個(gè)NH2就寫(xiě)成如下格式： %chk=0007_H8N4Fe_neutral.chk %mem=16GB %nprocshared=16 # opt=gdiis freq b3lyp/6-311+g* geom=connectivity scf=(maxcycle=200,xqc) Title Card Required 0 5 Fe -0.91754600 -0.46831100 0.27157400 H -1.45244500 -0.76586600 1.83722800 N 0.16000600 1.48253700 0.21099400 H 1.14777100 1.24446300 0.16141600 H -3.16465200 1.08078500 -0.70341000 N 4.18178500 -0.54864800 -0.29920800 H 0.02178700 2.02434800 1.05949300 H -0.06401700 -1.31732100 -0.90479000 N 3.37090400 0.17099000 -0.13735000 H -0.03924300 2.08668100 -0.58176900 H -1 -3.54974800 -0.38967500 -0.09381000 N -1 -2.87137700 0.10755200 -0.66468000 H -1 -2.93247200 -0.27433300 -1.60356000 1 2 3 4 1.0 7 1.0 10 1.0 4 5 12 1.0 6 9 3.0 7 8 9 10 11 12 1.0 12 13 1.0 13 |
3樓2016-09-26 08:56:59
小范范1989
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對(duì)，不過(guò)你的任務(wù)是不是想優(yōu)化+freq？我感覺(jué)，計(jì)算的時(shí)候，表頭寫(xiě)的越簡(jiǎn)單越好，而且你這個(gè)maxcycle=200壓根就沒(méi)有用。 我感覺(jué)就寫(xiě)opt freq就行。亂七八糟的命令不要寫(xiě)。除非出現(xiàn)的問(wèn)題，調(diào)節(jié)收斂等等。個(gè)人見(jiàn)解 |
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05021140734樓2016-09-26 09:25:35
0502114073
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5樓2016-09-26 09:38:27
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