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[求助]
利用CODEHOP軟件簡并引物設(shè)計(jì)
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已經(jīng)設(shè)計(jì)了一對引物，可以得到目的條帶，但篩選不出來，現(xiàn)在重新設(shè)計(jì)，希望可以篩選到，有幾個(gè)問題，希望大家?guī)兔獯饉 1.利用我自己的產(chǎn)酶基因(來源里氏木霉)在NCBI中進(jìn)行blastx(核酸blast蛋白)，得到一百條同源序列，ident有高有低，將這100條保存成fasta格式，保守序列對比 問題:我選的序列是否合理，多不多，還是只選擇幾個(gè)有代表性的？ 2.codon usage table中沒有我的里氏木霉，倒是有相似性75%的Neurospora crassa 我可以選這個(gè)嘛？該怎么選呢？ 3.目的:從土壤中篩選未培養(yǎng)產(chǎn)酶微生物 如果這次成功，一定寫一個(gè)分享教程，希望大家?guī)蛶臀野 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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xn8008: 歡迎發(fā)帖交流 2016-10-13 11:45:54
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補(bǔ)充:對于第二個(gè)codon usage table的選擇問題上，我考慮的是怕選擇75%相似性的這個(gè)，土壤中可能含量很少~有點(diǎn)不太明白，希望大家答疑解惑 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2016-10-13 10:23:04
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