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play900325鐵蟲 (小有名氣)
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positional parameter怎么轉(zhuǎn)換成以angstrom做單位的cartesian坐標(biāo)？ 已有1人參與
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晶體版的蟲友們好！ 我最近需要從文獻(xiàn)里面找?guī)讉�晶體結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)和我的計(jì)算結(jié)果做比對，就是需要實(shí)驗(yàn)的geometry。我下了好幾篇很老的文獻(xiàn)，里面關(guān)于positional parameter的部分都很奇怪。我直接放在可視化軟件中原子會擠到一起，用鍵長鍵角可以得到部分結(jié)構(gòu)，但因?yàn)槿鄙俣娼菙?shù)據(jù)，我想要了解的conformation還是沒辦法得到。 文獻(xiàn)里面positional parameter會給這種數(shù)據(jù)： O1' -0.1091 -0.3326 -0.4368 C1' -0.1576 -0.3346 -0.2425 然后還會說明這兩個原子的distance是1.444 angstrom。但我完全不知道是怎么得到的，就算這個是Bohr單位轉(zhuǎn)換成angstrom得到的數(shù)據(jù)也不對。我想請教一下做晶體的各位，我怎么從positional parameter里面得到我需要的適合量子化學(xué)計(jì)算的geometry�。烤褪菃挝籥ngstorm，謝謝各位！ |
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2樓2016-10-27 10:08:26
magicmonk
至尊木蟲 (著名寫手)
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- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2016-10-27 15:55:36
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