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龍翔晨風(fēng)新蟲 (初入文壇)
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NCBI中序列編號有非XP開頭的，其代表什么意思？怎么來的？ 已有1人參與
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| NCBI中序列編號有XP開頭的代表的是轉(zhuǎn)錄組測出來的，那其他編號代表什么意思？怎么來的？望大神指點��！ |
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xingzhou823
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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ACCESSION MOLECULE METHOD NOTE AC_123456 Genomic Mixed 一些可供選擇的注釋的基因組序列，主要用來標(biāo)記病毒和原核生物。 AP_123456 Protein Mixed AC_標(biāo)記序列對應(yīng)的蛋白產(chǎn)物。 NC_123456 Genomic Mixed 完整的基因組分子序列，標(biāo)記的類別包括基因組、染色體、細(xì)胞器、質(zhì)粒。 NG_123456 Genomic Mixed 不完整的基因組區(qū)域，提供NCBI基因組注釋途徑。比較有代表性有不轉(zhuǎn)錄的假基因或者那些很難自行化注釋的基因組簇。 NM_123456 NM_123456789 mRNA Mixed 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物序列；成熟mRNA轉(zhuǎn)錄本序列。 NP_123456 NP_123456789 Protein Mixed 蛋白產(chǎn)物；主要是全長轉(zhuǎn)錄氨基酸序列，但也有一些只有部分蛋白質(zhì)的部分氨基酸序列。 NR_123456 RNA Mixed 非編碼的轉(zhuǎn)錄子序列，包括結(jié)構(gòu)RNAs，假基因轉(zhuǎn)子等。 NT_123456 Genomic Automated BAC或者鳥槍測序法的還未完全注釋的測序序列。 NW_123456 NW_123456789 Genomic Automated BAC或者鳥槍測序法的還未完全注釋的測序序列。 NZ_ABCD12345678 Genomic Automated 收集的各種利用鳥槍法測序的測序計劃，ABCD代表的是計劃的名稱。 XM_123456 XM_123456789 mRNA Automated 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物；mRNA來自基因組注釋，序列相當(dāng)于基因組重疊群。 XP_123456 XP_123456789 Protein Automated 蛋白產(chǎn)物。序列相當(dāng)于基因組重疊群。 XR_123456 RNA Automated 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物；非編碼區(qū)來自基因組注釋，序列相當(dāng)于基因組重疊群。 YP_123456 YP_123456789 Protein Mixed 蛋白產(chǎn)物。不涉及到轉(zhuǎn)錄，主要用來標(biāo)記細(xì)菌、病毒和線粒體。 ZP_12345678 Protein Automated 蛋白產(chǎn)物，主要是用電腦自動注釋。 NS_123456 Genomic Automated 未知生物分子基因組序列。 |
2樓2016-11-25 09:26:50
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