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548446557金蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何確定NEB計(jì)算是否成功 已有1人參與
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如何判斷NEB計(jì)算是否收斂，是不是01,02...等文件夾中的OUTCAR得收斂才行？按照教程查看nebef.pl，得到圖1，nebbarrier.pl得到neb.dat文件，cat neb.dat得到圖2，nebresults.pl得到圖3，有一堆亂七八糟東西了，接著卡主了，重啟后發(fā)現(xiàn)文件如圖4，但是mep.eps里面亂七八糟，不知道如何做成origin能壘圖，求教如何判斷NEB收斂，另外，如果沒(méi)有收斂，怎么接著算，發(fā)現(xiàn)每個(gè)CONCAR文件中下面一堆NaN，不知道是啥意思，將CONCAR改成POSCAR能接著算嗎？ 1.jpg 2.jpg 3.jpg 4.jpg |
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【答案】應(yīng)助回帖
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548446557(蛋蛋小童鞋代發(fā)): 金幣+5, 謝謝參與，小木蟲鼓勵(lì)積極回答問(wèn)題者 2016-12-29 16:36:14
548446557(蛋蛋小童鞋代發(fā)): 金幣+5, 謝謝參與，小木蟲鼓勵(lì)積極回答問(wèn)題者 2016-12-29 16:36:14
| 做過(guò)渡態(tài)計(jì)算。首先要保證達(dá)到收斂，即slurm或者runlog中顯示reached required accuracy ,收斂之后需要做一個(gè)頻率分析來(lái)進(jìn)行驗(yàn)證找到的過(guò)渡態(tài)是否是真正的過(guò)渡態(tài)，只有一個(gè)虛頻的話，說(shuō)明是。你的eps文件打開時(shí)亂七八糟的東西，估計(jì)是你打開的方式不對(duì)吧，應(yīng)該是能壘與坐標(biāo)的曲線圖才對(duì)。 |
6樓2016-12-29 14:22:26
548446557
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7樓2016-12-29 15:01:38
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9樓2016-12-29 16:34:23
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10樓2016-12-29 16:48:20
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