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尋找過渡態(tài)柔性掃面相關(guān) 已有1人參與
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木蟲 (著名寫手)

木蟲 (著名寫手)

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還是出錯(cuò),這樣操作是什么依據(jù)呢? 這是報(bào)錯(cuò)信息 Cartesian Forces: Max 0.000398598 RMS 0.000132725 GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad Berny optimization. NTrRot= -1 NTRed= 35 NAtoms= 8 NSkip= 17 IsLin=F Error in internal coordinate system. Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g09a02/g09/l103.exe at Sun Dec 11 18:04:34 2016. Job cpu time: 0 days 0 hours 2 minutes 20.5 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 10 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |


新蟲 (正式寫手)
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新蟲 (正式寫手)
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木蟲 (著名寫手)
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1、無論是柔性還是剛性掃描,都不用設(shè)置初始值,因?yàn)槌跏贾悼梢愿鶕?jù)你給定的分子說明計(jì)算出來,不需要特別說明,所以去掉180.0。另外,內(nèi)坐標(biāo)錯(cuò)誤是因?yàn)楦咚估镦I角不能人為設(shè)置為180,即你不能從180°開始掃,但是你可以反過來從90°掃到180°,對(duì)于勢(shì)能面來說沒有區(qū)別,親測(cè)可以。 2、柔性掃描掃的是勢(shì)能面,通過勢(shì)能面可能可以找到過渡態(tài)的近似結(jié)構(gòu),和頻率沒有關(guān)系,也不需要算頻率,而且你對(duì)頻率和過渡態(tài)的理解有很大誤區(qū),建議去了解一下相關(guān)知識(shí)。 3、建議以后不要用貼圖的方式貼你的輸入文件,我?guī)湍銣y(cè)試還要一個(gè)一個(gè)原子自己輸,過于麻煩。 |
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