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僅僅知道蛋白的氨基酸序列 如何得知cDNA核酸序列
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在MPMI上找到了一篇與自己研究課題相關(guān)的文獻 ， 由于那篇文章挖掘了新的effector，而且做的齡期表達，所以很想找些其中 感覺很不錯的effector做做Y2H。但是要命的是文中沒有給出NCBI上的序列號，所以無從下手后來又在另一篇文獻里面發(fā)現(xiàn)國內(nèi)一個 同行大牛找到了編號相同的序列，欣喜若狂，終于知道了序列被上傳到了其他的數(shù)據(jù)庫中，但是在那個數(shù)據(jù)庫里面，只有蛋白序列， 琢磨了半天也沒找到相關(guān)的核酸序列。 想用氨基酸序列反推 但是其實太難了 ，用ncbi上的BLAST 來找蛋白與轉(zhuǎn)錄組的blast 試了幾個數(shù)據(jù)庫的類似蛋白都沒結(jié)果。 小老板說可以找?guī)熜值呐笥颜乙幌�，但是師兄的朋友最近剛�(cè)ッ览麍粤?沒網(wǎng) 好氣。。。 如果去找國內(nèi)的同行大牛 就要和導師說一聲，畢竟都是認識的人，國內(nèi)做我們這一行的就那幾個。。。 所以說 有沒有好一點的氨基酸序列反推核算序列的方法呢？  |
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ken19860823
木蟲 (正式寫手)
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2樓2016-12-16 16:46:20
3樓2016-12-16 23:22:49
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